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长吻鮠雌雄性腺转录组比较分析
引用本文:樊佳慧,叶欢,宋信华,岳华梅,黄玲,阮瑞,郜卫华,李创举. 长吻鮠雌雄性腺转录组比较分析[J]. 中国水产科学, 2024, 31(2): 129-143
作者姓名:樊佳慧  叶欢  宋信华  岳华梅  黄玲  阮瑞  郜卫华  李创举
作者单位:长江大学动物科学学院, 湖北 荆州 434024 ;中国水产科学研究院长江水产研究所, 农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室, 湖北 武汉 430223;湖北省长吻鮠良种场, 湖北 石首 434400
基金项目:国家重点研发计划子课题(2022YFD400101); 中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2022XT03 和 2023TD03); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(YFI202206); 贵州省科技计划项目([2020]4Y027).
摘    要:长吻鮠(Leiocassis longirostris)是淡水特色经济鱼类, 其雄性生长速度快于雌性, 培育全雄苗种可显著提高养殖效益。为加快长吻鮠全雄苗种培育进程, 需深入了解长吻鮠性别分化及性腺发育的调控机制。本研究通过 Illumina 高通量测序平台对长吻鮠卵巢和精巢进行转录组测序分析。结果显示, 共有 10872 个雌雄差异表达基因, 其中上调基因 9375 个, 下调基因 1497 个。通过功能注释, 筛选出 71 个与性别相关的重要候选基因, 包括 50 个精巢高表达基因(dmrt1、cyp17a1、samd7、wnt6、wt1 等)和 21 个卵巢高表达基因(foxl2、gdf9、zp3、zp1、figla、bmp15 等)。KEGG 通路富集分析发现, 差异表达基因显著富集到 16 条与性别决定与分化及性腺发育相关的信号通路, 包括 Wnt 信号通路、TGF-β 信号通路、MAPK 信号通路、卵巢类固醇通路、GnRH 信号通路等。本研究筛选出与长吻鮠性别决定和分化相关差异表达基因, 揭示参与其雌雄个体性腺发育的信号通路, 为今后长吻鮠性别决定和分化机制的研究积累重要数据, 从而为其全雄苗种的培育提供理论支撑。

关 键 词:长吻鮠; 转录组; 性腺发育; 差异表达基因
收稿时间:2023-11-14
修稿时间:2023-12-11

Comparative transcriptomic analysis of male and female gonads of the Chinese longsnout catfish (Leiocassis longirostris)
FAN Jiahui,YE Huan,SONG Xinhu,YUE Huamei,HUANG Ling,RUAN Rui,GAO Weihu,LI Chuangju. Comparative transcriptomic analysis of male and female gonads of the Chinese longsnout catfish (Leiocassis longirostris)[J]. Journal of Fishery Sciences of China, 2024, 31(2): 129-143
Authors:FAN Jiahui  YE Huan  SONG Xinhu  YUE Huamei  HUANG Ling  RUAN Rui  GAO Weihu  LI Chuangju
Affiliation:School of Animal Science, Yangtze University, Jingzhou 434024 , China ;Key Laboratory of Freshwater Biodiversity Conservation, Ministry of Agriculture and Rural Affairs of China , YangtzeRiver Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuhan 430223 , China;Hubei Product Farm of Leiocassis longirostris, Shishou 434400 , China
Abstract:
Keywords:
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