| 玉米SBP转录因子全基因组鉴定与功能分析 |
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| 引用本文： | 彭华,何秀静,高健,罗茂,潘光堂,张志明.玉米SBP转录因子全基因组鉴定与功能分析[J].作物学报,2016,42(2):201-211. |
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| 作者姓名： | 彭华 何秀静 高健 罗茂 潘光堂 张志明 |
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| 作者单位： | 1 四川旅游学院，四川成都 610100；2 四川农业大学玉米研究所，四川温江 611130；3四川医科大学药物与功能性食品研究中心，四川泸州 646000；4第三军医大学西南医院病理学研究所西南癌症中心，重庆 400038 |
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| 基金项目： | 本研究由国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2012AA10A307)和四川省科技厅青年基金项目(2015JQO021)资助。 |
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| 摘 要： | SBP基因家族是一类植物基因组特有的转录因子,参与植物生长发育及多种生理生化过程。近来,大量研究已在多种植物中鉴定出SBP转录因子,但关于玉米(Zea mays L.)SBP转录因子家族的系统分析报道尚少。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与玉米基因组数据比对,并设置一系列严格的筛选标准从玉米基因组中挖掘SBP转录因子,系统发育分析显示单子叶植物玉米和水稻的SBP基因保守性更强、亲缘关系更近;共鉴定37个SBP基因,分布在9条染色体上;通过基因分析注释以及启动子功能预测,进一步发现SBP家族基因参与植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应、花器官发育以及植物光反应等过程。并且,玉米SBP转录因子可通过参与赤霉素、生长素、脱落酸、水杨酸等多条激素信号调控途径来调节植物的生长发育。
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| 关 键 词： | 玉米 SBP转录因子家族 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2015-05-12 |
Genome-wide Identification and Function Analysis of SBP Gene Family in Maize |
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| PENG Hua,HE Xiu-Jing,GAO Jian,LUO Mao,PAN Guang-Tang,ZHANG Zhi-Ming.Genome-wide Identification and Function Analysis of SBP Gene Family in Maize[J].Acta Agronomica Sinica,2016,42(2):201-211. |
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| Authors: | PENG Hua HE Xiu-Jing GAO Jian LUO Mao PAN Guang-Tang ZHANG Zhi-Ming |
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| Institution: | 1.SiChuan Tourism College, Chengdu 610100, China; Maize Research Institute of Sichuan Agricultural University, Wenjiang 611130, China;3.Research Center for Drug Discovery of Luzhou Medical College, Luzhou 646000, China, 4 Institute of Pathology and Southwest Cancer Center, Southwest Hospital, Third Military Medical University, and Key Laboratory of Tumor Immunopathology, Ministry of Education, Chongqing 400038, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Maize SBP TFs gene family Bioinformatics |
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