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基于SSR扩增与测序分析的主栽烤烟品种遗传多样性研究
引用本文:田阳阳,轩贝贝,王正旭,刘魁,郭建华,牟文君,戴华鑫,杨继周,宋纪真,胡利伟.基于SSR扩增与测序分析的主栽烤烟品种遗传多样性研究[J].江西农业学报,2021,33(10):73-79.
作者姓名:田阳阳  轩贝贝  王正旭  刘魁  郭建华  牟文君  戴华鑫  杨继周  宋纪真  胡利伟
作者单位:红塔烟草(集团)有限责任公司,云南 玉溪653100;中国烟草总公司 郑州烟草研究院,河南 郑州450001
摘    要:利用SSR荧光标记和毛细管电泳检测技术分析了SSR标记在8个烤烟品种烤后烟叶中的多态性和稳定性.结果表明:PCR产物浓度50~100 ng/μL为毛细管电泳检测较合适的上样浓度;利用83对SSR引物对8个烤烟品种进行PCR扩增,最终确定5对(NTGS66288、PT30250、PT30213、PT52573、PT30170)SSR引物为本研究的核心引物,且多态性分析表明这5对引物能够有效地将8个烤烟品种区分开;8个烤烟品种间的遗传相似性系数为0.30~0.86,当此系数为0.76时,云烟87、NC297、云烟97和中烟100聚为一类,K326和KRK26聚为一类,红花大金元、翠碧1号各自为一类;高通量测序结果显示NTGS66288、PT30250、PT30213、PT52573、PT30170等5个SSR位点基因座的核心重复单元多为简单二碱基重复和三碱基重复,且8个品种之间的差异仅为核心重复单元数量不同.

关 键 词:烤烟  SSR标记  毛细管电泳  遗传多样性  高通量测序

Study on Genetic Diversity of Main Flue-cured Tobacco Cultivars Based on SSR Amplification and Sequencing Analysis
TIAN Yang-yang,XUAN Bei-bei,WANG Zheng-xu,LIU Kui,GUO Jian-hua,MOU Wen-jun,DAI Hua-xin,YANG Ji-zhou,SONG Ji-zhen,HU Li-wei.Study on Genetic Diversity of Main Flue-cured Tobacco Cultivars Based on SSR Amplification and Sequencing Analysis[J].Acta Agriculturae Jiangxi,2021,33(10):73-79.
Authors:TIAN Yang-yang  XUAN Bei-bei  WANG Zheng-xu  LIU Kui  GUO Jian-hua  MOU Wen-jun  DAI Hua-xin  YANG Ji-zhou  SONG Ji-zhen  HU Li-wei
Abstract:
Keywords:
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