| 蜱携带牛丙型肝炎病毒新亚型巢式PCR检测方法的建立 |
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| 引用本文： | 郭銮英,王妮娜,李杭远,纪雨霏,马骏,裴明超,邵建伟,刘全.蜱携带牛丙型肝炎病毒新亚型巢式PCR检测方法的建立[J].畜牧兽医学报,2022,53(3):972-977. |
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| 作者姓名： | 郭銮英 王妮娜 李杭远 纪雨霏 马骏 裴明超 邵建伟 刘全 |
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| 作者单位： | 佛山科学技术学院生命科学与工程学院, 佛山 528000 |
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| 基金项目： | 广东省珠江人才计划项目(2019CX01 N111);佛山科学技术学院2020年度学生学术基金(xsjj202009kja01) |
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| 摘 要： | 旨在提高新发现的牛丙型肝炎病毒毒株——广东湛江毒株(bovine hepacivirus-GDZJ,BovHepV-GDZJ)的检测及诊断能力,初步了解广东地区蜱携带BovHepV-GDZJ的情况,本研究结合宏转录组学、高通量测序及PCR技术,针对高通量测序结果中丰度高的基因区域,设计该病毒的巢式PCR特异性引物。通过优化巢式PCR方法的最佳退火温度,建立检测BovHepV-GDZJ的特异性巢式PCR检测方法。结果显示:本方法对该病毒标准质粒最低检测值为6.8 copies·μL-1;对沙粒病毒等蜱携带的常见病原均无反应;应用此方法对115份广东湛江的蜱样品进行了检测,测序结果显示,该批蜱携带BovHepV阳性率为46.08%(53/115)。本研究首次在蜱中检测到BovHepV,揭示了BovHepV可能的传播途径,并建立了一套针对BovHepV-GDZJ株的特异性巢式PCR检测方法,为广东地区检测和预防BovHepV提供技术帮助,也为控制BovHepV的流行提供参考。
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| 关 键 词： | 牛丙型肝炎病毒 巢式PCR 蜱 高通量测序 |
| 收稿时间： | 2021-05-18 |
The Development of Nested PCR Assay for New Subtype of Bovine Hepacivirus in Ticks |
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| GUO Luanying,WANG Nina,LI Hangyuan,JI Yufei,MA Jun,PEI Mingchao,SHAO Jianwei,LIU Quan.The Development of Nested PCR Assay for New Subtype of Bovine Hepacivirus in Ticks[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2022,53(3):972-977. |
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| Authors: | GUO Luanying WANG Nina LI Hangyuan JI Yufei MA Jun PEI Mingchao SHAO Jianwei LIU Quan |
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| Institution: | College of Life Sciences and Engineering, Foshan University, Foshan 528000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | bovine hepacivirus nested PCR tick high-throughput sequencin |
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