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系统分析多组织转录组鉴定影响猪脂肪沉积的关键基因
引用本文:翟丽维,赵延辉,李文军,邢凯,王楚端. 系统分析多组织转录组鉴定影响猪脂肪沉积的关键基因[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(6): 1702-1711. DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2022.06.005
作者姓名:翟丽维  赵延辉  李文军  邢凯  王楚端
作者单位:1. 中国农业大学动物科技学院,北京 100193;2. 北京农学院动物科学技术学院,北京 102206;3. 北京三元种业科技股份有限公司,北京 100029
基金项目:国家重点研发计划(2019YFE0106800);
摘    要:旨在挖掘影响松辽黑猪脂肪沉积的关键基因及脂肪、肝和肌肉在体内的功能。本研究选择体重100 kg左右健康且背膘厚差异显著的6头(高、低各3头)松辽黑猪为试验动物,利用高通量转录组测序技术检测其脂肪、肝和背最长肌组织中基因的表达水平,鉴定不同脂肪沉积猪和不同组织中的差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能。结果表明,在不同分组的猪中发现135个差异表达基因,其中部分参与了PPAR信号通路、AMPK信号通路、代谢通路、脂肪酸代谢和甘油代谢等通路。经生物学功能分析发现,EHHADHME1、SCDOLR1、PHGDHACLYLEPCYP超家族基因等基因为影响猪脂肪沉积的关键基因。在不同组织的差异表达表达基因中,脂肪组织中高表达的基因显著富集在胰岛素信号通路、MAPK信号通路、三羧酸循环、氧化磷酸化等通路;肝中高表达基因显著富集在多种物质的代谢、脂肪酸的降解、氨基酸的合成等通路;背最长肌中高表达的基因主要参与了蛋白质的降解、PI3K-Akt信号通路、氧化磷酸化通路、Wnt信号通路、磷脂酰肌醇信号通路等通路。不同组间差异表达基因分析结果提示,EHHADHME1、SCDOLR1、PHGDHACLYLEPCYP超家族基因等基因是影响脂肪沉积的关键基因;不同组织间差异表达基因表明,脂肪组织是脂肪合成的主要部位,而肝和肌肉组织主要涉及脂肪酸的降解。本研究结果对脂肪性状的遗传改良、机理解析有一定意义。

关 键 词:松辽黑猪  多组织  转录组  系统分析  脂肪沉积  
收稿时间:2021-09-07

System Analysis of Multi Tissue Transcriptome to Identify Key Genes Affecting Porcine Fat Deposition
ZHAI Liwei,ZHAO Yanhui,LI Wenjun,XING Kai,WANG Chuduan. System Analysis of Multi Tissue Transcriptome to Identify Key Genes Affecting Porcine Fat Deposition[J]. Chinese Journal of Animal and Veterinary Sciences, 2022, 53(6): 1702-1711. DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2022.06.005
Authors:ZHAI Liwei  ZHAO Yanhui  LI Wenjun  XING Kai  WANG Chuduan
Affiliation:1. College of Animal Science and Technology, China Agricultural University, Beijing 100193, China;2. College of Animal Science and Technology, Beijing University of Agriculture, Beijing 102206, China;3. Beijing Sanyuan Breeding Technology Co. Ltd., Beijing 100029, China
Abstract:
Keywords:
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