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向日葵黑茎病菌RPA/CRISPR-Cas12a快速检测方法的建立
引用本文:邝瑞瑞,#,雷 荣#,江 丽,段维军,李雪莲,符 娜,范在丰,李 远,吴品珊.向日葵黑茎病菌RPA/CRISPR-Cas12a快速检测方法的建立[J].植物保护,2022,48(6):69-76.
作者姓名:邝瑞瑞  #  雷 荣#  江 丽  段维军  李雪莲  符 娜  范在丰  李 远  吴品珊
作者单位:(1. 中国检验检疫科学研究院, 北京 100176; 2. 中国农业大学植物保护学院, 北京 100093; 3. 重庆医科大学永川附属医院, 重庆 402177; 4. 宁波检验检疫科学技术研究院, 宁波 315012; 5. 伊犁师范大学, 伊犁 835000)
基金项目:国家重点研发计划(2021YFC2600400,2021YFC2600402);中国检验检疫科学研究院基本科研业务费(2020JK048)
摘    要:向日葵黑茎病菌是向日葵上的一种毁灭性真菌,是我国的植物检疫性有害生物。为了准确快速检测向日葵黑茎病菌,本研究根据向日葵黑茎病菌及其近似种的ITS序列差异,设计特异性RPA引物和CRISPR-Cas12a crRNA,建立了RPA等温扩增技术结合CRISPR-Cas12a检测的快速检测方法。通过条件优化,RPA/CRISPR-Cas12a检测体系在37℃恒温条件下,RPA反应30 min,CRISPR/Cas12a反应20 min,即可特异性检测向日葵黑茎病菌。荧光法检测灵敏度与实时荧光PCR的灵敏度相当,最低检测量为0.1 pg,试纸条法检测最低检测量为1 pg。由于试纸条检测结果可用肉眼观察,快速便携,操作简单,更适合用于田间和口岸的向日葵黑茎病菌快速早期检测;而荧光检测灵敏度高,对环境要求高,更适合用于实验室检测。

关 键 词:向日葵黑茎病菌    RPA    CRISPR-Cas12a    荧光检测    侧向流层析试纸条
收稿时间:2022/7/6 0:00:00
修稿时间:2022/9/19 0:00:00

Establishment of RPA/CRISPR-Cas12a rapid detection for Leptosphaeria lindquistii
KUANG Ruirui,#,LEI Rong#,JIANG Li,DUAN Weijun,LI Xuelian,FU N,FAN Zaifeng,LI Yuan,WU Pinshan.Establishment of RPA/CRISPR-Cas12a rapid detection for Leptosphaeria lindquistii[J].Plant Protection,2022,48(6):69-76.
Authors:KUANG Ruirui  #  LEI Rong#  JIANG Li  DUAN Weijun  LI Xuelian  FU N  FAN Zaifeng  LI Yuan  WU Pinshan
Institution:(1. Chinese Academy of Inspection and Quarantine, Beijing 100176, China; 2. College of Plant Protection, China Agricultural University, Beijing 100193, China; 3. Yongchuan Hospital Affiliated to Chongqing Medical University; Chongqing 402177, China; 4. Ningbo Academy of Inspection and Quarantine, Ningbo 315012, China; 5. Yili Normal University, Yili 835000, China)
Abstract:
Keywords:Leptosphaeria lindquistii  RPA  CRISPR-Cas12a  fluorescent detection  lateral flow strip
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