| 三桠苦叶绿体基因组结构和序列特征分析 |
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| 作者姓名： | 吴民华 陈依虹 谭靖怡 邹山扬 叶晓霞 黄琼林 |
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| 作者单位： | 1.广东医科大学基础医学院，广东 湛江 524023；2.广东医科大学第一临床医学院，广东 湛江524023；3.广东医科大学药学院，广东 湛江 524023 |
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| 基金项目： | 广东省基础与应用基础研究基金项目(2018A030310116)；广东省大学生创新创业训练计划项目(S202310571113)；湛江市科技计划项目(2019A01008)；广东医科大学大学生创新创业训练计划项目(GDMU2022113) |
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| 摘 要： | 为了探明岭南地区特色中药三桠苦的叶绿体基因组结构和序列特征，以三桠苦叶片为材料，采用试剂盒法提取DNA和构建测序文库，利用Novaseq平台进行高通量测序，再结合生物信息学手段进行序列拼接、注释和特征分析。结果显示：三桠苦叶绿体基因组为158 992 bp的环状四分体分子，含有134个基因；在三桠苦叶绿体基因组内找到86个简单重复序列，主要是A/T单核苷酸重复；检测到26 907个密码子，以A/T结尾的密码子有着更高的使用频次；序列比较分析表明，三桠苦与同科植物在非编码区存在更明显的序列变异；系统进化树揭示不同来源的三桠苦亲缘关系最近，但在基因组成和碱基序列上呈现出多样性。
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| 关 键 词： | 三桠苦；叶绿体基因组；结构特征；序列比对 |
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