健康水牛与患子宫内膜炎水牛子宫内细菌组成的比较分析

应用16SrDNA克隆文库的方法,分别建立健康和患子宫内膜炎水牛子宫内细菌的16SrDNA克隆文库,并通过序列分析和同源性比对确定细菌的系统发育学地位。结果显示,产后14d水牛子宫内的细菌主要属于梭杆菌门(Fusobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)和变形菌门(Proteobacteria)。患子宫内膜炎组(M组)中有38.89%克隆的属于梭杆菌门(Fusobacteria),序列比对分析表明,这些序列和Fusobacterium necrophorum subsp有最高的的相似度(99%)。另外46.67%的克隆属于拟杆菌门(Bacteroidetes),其中Bacteroides heparinolyticus和Porphyromonas levii在这个门中所占比例最大,分别为55.95%和42.86%,属于厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteri)的克隆较少,所占比例分别为7.22%和6.67%,但是这2个门中的细菌种类相对丰富。仅仅只有0.56%属于放线菌门(Actinobacteria)。健康组(H组)中,26.56%的克隆属于梭杆菌门(Fusobacteria),并且和Fusobacterium necrophorum subsp的相似度最高(99%),32.81%的克隆属于Firmicutes,这些克隆中的61.9%与Clostridium cadaveris的相似性最高(≧97%),35.94%的克隆属于Bacteroidetes,其中56.52%的序列与Bacteroides heparinolyticus相似性最高(99%)。克隆中属于Proteobacteria的比例较低(4.69%)。结果表明,Fusobacterium necrophorum subsp、Bacteroides heparinolyticus和Porphyromonas levii可能是引起水牛产后子宫内膜炎的主要致病菌。厚壁菌门细菌Clostridium cadaveris,拟杆菌门细菌Porphyromonas somerae、Bacteroides pyogenes可能有利于子宫内膜的恢复。

Comparative analysis of uterine bacterial composition in healthy and endometritis buffaloes