| 偃麦草EST-SSR标记开发及应用 |
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| 引用本文： | 王瑞晶,李培英,张延辉.偃麦草EST-SSR标记开发及应用[J].草业科学,2016,33(8):1526-1535. |
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| 作者姓名： | 王瑞晶 李培英 张延辉 |
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| 作者单位： | 新疆农业大学草业与环境科学学院,新疆草地资源与生态自治区重点实验室,新疆乌鲁木齐830052;新疆农业大学草业与环境科学学院,新疆草地资源与生态自治区重点实验室,新疆乌鲁木齐830052;新疆农业大学草业与环境科学学院,新疆草地资源与生态自治区重点实验室,新疆乌鲁木齐830052 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31360580)，新疆农业大学研究生科研创新项目(XJAUGRI2015002) |
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| 摘 要： | 利用NCBI数据库中偃麦草(Elytrigia repens)EST序列开发偃麦草EST-SSR引物,并对47份偃麦草资源进行遗传多样性分析,验证所开发EST-SSR引物在偃麦草上的可应用性。结果显示,在27 891条偃麦草EST序列中可以搜索到SSR位点1 068个;其中六核苷酸重复序列最多,占总SSR的53.83%;二、三、四、五、六核苷酸优势重复基元及出现频率分别为AC/TG(2.72%)、CGC/GCG(1.87%)、CGAC/GCTG(5.24%)、CCGCC/GGCGG(0.37%)、CAGCTC/GTCGAG(3.37%)。开发的105对偃麦草EST-SSR引物中有64对引物(60.95%)可以有效扩增;随机选取18对多态性引物对47份偃麦草进行遗传多样性分析,其多态性百分率为78.64%,多态性指数(PIC)为0.22~0.83。以上结果表明,开发的偃麦草EST-SSR标记是有效的,有较高的应用价值,为偃麦草遗传多样性、重要性状关联分析研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 偃麦草 EST-SSR 标记开发 遗传多样性 |
Development of Elytrigia repens EST-SSR markers and its application |
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| Wang Rui-jing,Li Pei-ying,Zhang Yan-hui.Development of Elytrigia repens EST-SSR markers and its application[J].Pratacultural Science,2016,33(8):1526-1535. |
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| Authors: | Wang Rui-jing Li Pei-ying Zhang Yan-hui |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Elytrigia repens EST-SSR marker development genetic diversity |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
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