| 稻瘟病菌阅读框架中SSR频率、分布及所在基因功能 |
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| 引用本文： | 李成云,李进斌,周晓罡,张绍松,董爱荣,许明辉. 稻瘟病菌阅读框架中SSR频率、分布及所在基因功能[J]. 中国水稻科学, 2005, 19(2): 167-173 |
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| 作者姓名： | 李成云 李进斌 周晓罡 张绍松 董爱荣 许明辉 |
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| 作者单位： | 1. 云南省农业科学院,生物技术研究所,农业部南方高原农业生物技术重点实验室,云南,昆明,650223
2. 云南省农业科学院,植物保护研究所,云南,昆明,650205 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30360061)，云南省自然科学基金重点项目(1999C008Z)。 |
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| 摘 要： | 在对稻瘟病菌基因组中SSR分布进行了系统分析的基础上，对由1～6个碱基为重复单元的SSR在基因的蛋白质编码区中的分布进行了分析。结果表明，该病原菌的2 378个基因的编码区中共分布有3 240个SSR序列（标准是15 bp以上，匹配值为80％）。在已经有注释的4 732个基因中，861个基因的编码区中有SSR。编码区中的SSR以三碱基重复和六碱基重复为主，其他类型的SSR则很少在编码区中出现。SSR在这些基因中很少有保守性，表明这些基因的高度变异，或者起源是较晚的。含有SSR的基因多为转录蛋白、信号传导的细胞调节基因这一现象表明，SSR在物种形成过程中有重要作用。利用基因编码区中丰富的SSR序列信息及其变化带来的功能变化的信息，将可以在该菌功能基因组的研究中发挥十分重要的作用。
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| 关 键 词： | 稻瘟病菌 基因组 微卫星序列 分布 蛋白质编码区 功能基因组学 |
| 文章编号： | 1001-7216(2005)02-0167-07 |
| 收稿时间： | 1900-01-01; |
Frequency and Distribution of Microsatellites in Open Reading Frame of Rice Blast Fungus, Magnaporthe grisea |
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| LI Cheng-yun,LI Jin-bin,ZHOU Xiao-Gang,ZHANG Shao-song,DONG Ai-rong,XU Ming-hui. Frequency and Distribution of Microsatellites in Open Reading Frame of Rice Blast Fungus, Magnaporthe grisea[J]. Chinese Journal of Rice Science, 2005, 19(2): 167-173 |
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| Authors: | LI Cheng-yun LI Jin-bin ZHOU Xiao-Gang ZHANG Shao-song DONG Ai-rong XU Ming-hui |
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| Affiliation: | LI Cheng yun 1,LI Jin bin 2,ZHOU Xiao gang 1,ZHANG Shao song 1,DONG Ai rong 1,XU Ming hui 1 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Magnaporthe grisea genome simple sequence repeat distribution protein coding region functional genomics |
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