庆阳驴mtDNA D-loop区遗传多样性及起源分析

【目的】研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源，了解其遗传信息，为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。【方法】随机选取133头庆阳驴，对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对，并探讨庆阳驴的遗传多样性与母系起源。【结果】在获得的520 bp D-loop碱基序列中，AT含量(57.3%)高于GC含量(42.8%),表现出碱基的偏倚性；检测到38个变异位点，包含8个碱基对的转换；其核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异(K)分别为0.01591、0.895和8.274,与欧洲家驴和中国家驴研究的平均值相比较低，说明该驴品种核苷酸变异较为贫乏。庆阳驴mtDNA D-loop区存在35个单倍型，单倍型之间的遗传距离为0.002～0.042。系统进化结果显示，庆阳驴存在2个线粒体支系，表明其具有2个母系起源，且遗传距离表明，庆阳驴与克罗地亚家驴之间的遗传距离较近。【结论】本研究从分子水平初步揭示庆阳驴核苷酸变异比较贫乏，杂交程度高，mtDNA遗传多态性正逐步丧失，应加强庆阳驴品种的遗传资...