合作猪SIRT3基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究 |
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引用本文: | 闫尊强,梁毓豪,宋科林,滚双宝,王鹏飞.合作猪SIRT3基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究[J].中国畜牧兽医,2024(4):1390-1399. |
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作者姓名: | 闫尊强 梁毓豪 宋科林 滚双宝 王鹏飞 |
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作者单位: | 1. 甘肃农业大学动物科学技术学院;2. 甘肃省现代养猪工程技术研究中心 |
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摘 要: | 【目的】克隆合作猪沉默信息调节因子3(silence information regulator 3,SIRT3)基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析,探究SIRT3基因在合作猪不同组织中的表达水平,为研究SIRT3基因功能奠定基础。【方法】试验选择3月龄合作猪公猪3头,采集心脏、睾丸、肺脏等组织,采用PCR扩增、Sanger测序等方法获取SIRT3基因CDS区序列,并通过Mega 7.0软件构建系统进化树;通过生物信息学在线软件分析SIRT3蛋白结构和功能;采用实时荧光定量PCR检测SIRT3基因在合作猪不同组织中的表达量。【结果】合作猪SIRT3基因CDS区长774 bp,共编码257个氨基酸。系统进化树结果显示,合作猪与家猪亲缘关系最近,与斑马鱼亲缘关系最远。SIRT3蛋白的分子质量为28.68 ku,理论等电点为5.81,不稳定系数为37.92,为稳定性亲水蛋白;该蛋白不存在跨膜区域,无信号肽,但存在2个低复杂度结构域,主要分布于内质网中;SIRT3蛋白的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,三级结构模型预测结果与二级结构基本一致。实时荧光定量PCR结果显示,SIRT3...
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关 键 词: | 合作猪 SIRT3基因 克隆 生物信息学分析 组织表达 |
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