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青稞条纹病LAMP检测体系的建立
引用本文:胡章薇,杨 帆,张学飞,等.青稞条纹病LAMP检测体系的建立[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2021,49(11):105-114.
作者姓名:胡章薇  杨 帆  张学飞  
作者单位:青海大学 农林科学院,青海省农业有害生物综合治理重点实验室/农业农村部西宁作物有害生物科学观测实验站
基金项目:青海省基础研究计划项目(2020-ZJ-748);青海省重点实验室项目(2020-ZY-Y11)
摘    要:【目的】建立青稞条纹病的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术检测体系,为青稞种子带菌检测及其条纹病的有效防控提供参考。【方法】根据麦类核腔菌(Pyrenophora graminea)的ITS-rDNA序列区间设计5组引物,从中筛选特异性引物,并通过设置60,61,62,63,64和65 ℃ 6个温度梯度来优化LAMP反应体系的温度,以建立高效检测麦类核腔菌的LAMP技术体系;分别以麦类核腔菌、大麦坚黑粉菌、裸黑粉菌、禾生指葡孢霉、细链格孢和禾谷镰孢菌基因组DNA为模板进行LAMP扩增反应,对该体系的特异性进行检测;以310,31,3.1,0.31,0.031和0.003 1 pg/μL的麦类核腔菌基因组DNA为模板,对该体系的灵敏度进行分析;最后利用该体系对肚里黄、柴青1号、1141、北青9号和昆仑15 等5个青稞主栽品种的种子带菌率进行检测。【结果】青稞条纹病LAMP检测体系的特异性引物为引物组2,最佳反应温度63 ℃,反应时间70 min;该检测体系对麦类核腔菌具有良好的特异性,其最低检测限为0.31 pg/μL;肚里黄、柴青1号、1141、北青9号和昆仑15种子的带菌率分别为68.18%,72.73%,100%,77.27%和68.18%。【结论】建立了青稞条纹病LAMP检测体系,该体系能在63 ℃、70 min内检测出青稞种子是否携带条纹病菌。

关 键 词:青稞条纹病  环介导等温扩增  LAMP检测体系
收稿时间:2020/11/25 0:00:00

Establishment of LAMP detection system of Pyrenophora graminea
HU Zhangwei,YANG Fan,ZHANG Xuefei,et al.Establishment of LAMP detection system of Pyrenophora graminea[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2021,49(11):105-114.
Authors:HU Zhangwei  YANG Fan  ZHANG Xuefei  
Abstract:
Keywords:Pyrenophora graminea  loop-mediated isothermal amplification (LAMP)  LAMP detection system
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