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基于EST-SSR标记的陕西茶树种质资源遗传多样性研究
引用本文:班秋艳,潘宇婷,潘 铖,等.基于EST-SSR标记的陕西茶树种质资源遗传多样性研究[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2021,49(11):69-78.
作者姓名:班秋艳  潘宇婷  潘 铖  
作者单位:安徽农业大学 茶与食品科技学院;河南农业大学 园艺学院
基金项目:陕西省农业厅、林业厅科技专项“陕西省茶树种质资源普查及古茶树资源调查与保护”(陕农业发[2015]74号)
摘    要:【目的】明确陕西省茶树种质资源的遗传多样性,为茶树育种提供依据。【方法】以陕西地方和野生种质资源、陕西临近省份以及西南茶区共8个省份的118份茶树资源为材料,利用43对高质量EST-SSR引物,用PROSize 2.0软件统计扩增条带,用Powermarker V3.25分析软件计算主等位基因频率(MAF)、基因型、等位基因数(Na)、观测杂合度(Ho)、Nei基因多样性指数(H)和多态信息含量(PIC),用MEGA 6软件进行UPGMA聚类分析,对陕西茶树资源的遗传多样性进行分析。【结果】从118份茶树材料中共检测到310个等位基因和832个基因型。主等位基因频率(MAF)、每个位点等位基因数(Na)、扩增基因型和多态信息含量(PIC)的平均值分别为0.336 8,7.21个,19.35和0.727 2。Nei基因多样性指数(H)在0.232 3~0.911 0,平均值为0.760 0;观察到的杂合度(Ho)在0.105 7~0.991 8,平均值为0.811 2。聚类分析结果将陕西省茶树种质资源分为3大类群,同一地区的陕西茶树资源多聚在一起;对不同地区茶树资源的聚类结果表明,陕西省茶树资源聚为一支,且与湖北的茶树资源关系较近。【结论】陕西省茶树资源具有丰富的遗传多样性和相对独立的遗传背景,且与湖北省茶树资源遗传关系较近。

关 键 词:茶树育种  分子标记  EST-SSR  遗传多样性  陕西省
收稿时间:2020/12/11 0:00:00

EST-SSR analysis on genetic diversity of tea germplasm resources in Shaanxi Province
BAN Qiuyan,PAN Yuting,PAN Cheng,et al.EST-SSR analysis on genetic diversity of tea germplasm resources in Shaanxi Province[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2021,49(11):69-78.
Authors:BAN Qiuyan  PAN Yuting  PAN Cheng  
Abstract:
Keywords:Camellia sinensis breeding  molecular markers  EST-SSR  genetic diversity  Shaanxi Province
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