| 扁桃CBF1基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张亮,张智俊,李疆,代培红,罗淑萍.扁桃CBF1基因的克隆与生物信息学分析[J].中国农学通报,2014,30(34):16-23. |
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| 作者姓名： | 张亮 张智俊 李疆 代培红 罗淑萍 |
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| 作者单位： | 新疆农业大学农学院,浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地,新疆农业大学林学与园艺学院,新疆农业大学农学院,新疆农业大学农学院 |
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| 基金项目： | 基金项目：国家自然科学基金“新疆扁桃耐寒基因CBF1在花粉发育中的功能及其花粉发育避寒机制研究”(31360473)；国家自然科学基金“新疆野扁桃不同逆境梯度下的繁殖对策与生态适应性研究”(31260186)；新疆自治区“十二五”重大科技专项“新疆特色果树种质资源利用技术研究与示范”(201130102-1)；新疆自治区果树学重点学科基金。 |
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| 摘 要： | 为揭示CBF基因在扁桃抗逆机制中发挥的功能，对扁桃CBF1基因进行克隆与分析。以新疆扁桃主栽品种‘鹰嘴’为材料，根据已经报道的CBF1基因序列设计引物，通过PCR技术从扁桃基因组DNA中获得CBF1基因，命名为YZ-AcCBF1，并已登录GenBank（登录号KJ818900）。经生物信息学分析，该基因开放阅读框为729 bp，编码242个氨基酸，分子式为C1195H1886N346O368S13，相对分子质量为27.405 kDa，等电点为7.69，半衰期为30 h，脂肪系数为63.72，疏水性平均值为-0.646。对其亚细胞定位、跨膜结构、信号肽及疏水性/亲水性进行分析，表明其定位在细胞核，不存在跨膜结构，为非分泌性亲水蛋白。系统发育分析结果显示其与桃(AGS13699)的亲缘关系最近。二级结构预测显示该蛋白主要由26.86%的α螺旋和58.68%的无规卷曲组成。三维结构预测表明其符合AP2结构域模型特点。
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| 关 键 词： | 扁桃 克隆 CBF1 生物信息学 |
| 收稿时间： | 7/7/2014 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2014/11/23 0:00:00 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of CBF1 Gene in Amygdalus communis |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | almond cloning CBF1 bioinformatics |
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