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【目的】通过SNP芯片技术分析浦市黑猪群体遗传多样性和家系结构,为保护和利用浦市黑猪资源提供支撑。【方法】利用“中芯一号”50K SNP芯片,对79头成年浦市黑猪(10头公猪、69头母猪)进行SNP测定,采用多种分析软件(Plink、 Gmatix及Mega X)对群体遗传多样性和亲缘关系开展分析,进而构建群体家系结构。【结果】在79头浦市黑猪中共检出57 466个SNPs位点,平均基因型检出率为99.15%。遗传多样性分析提示SNP位点具有多态性,群体存在近交(有效群体含量Ne仅为1.5,且平均观察杂合度<平均期望杂合度)。群体平均状态同源(Idengtical by state,IBS)遗传距离为(0.294 9±0.072 6),公猪为(0.277 1±0.091 8),共检测到长纯合片段(Runs of hemozygosity,ROH)(29.60±16.12)个,其中长度在0~100 Mb的占40.5%,且群体基于ROH的平均近交系数为0.108。IBS距离矩阵、G矩阵结果以及群体ROH值的分析结果均反映出群体内个体之间存在较近的亲缘关系。根据群体进化树结果,将群体划... 相似文献
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浦市黑猪原产于湖南省泸溪县浦市镇,与桃源黑猪和大合坪猪统称湘西黑猪。笔者通过深入细致调查与研究,浦市黑猪相较于湘西黑猪另外两个类群,有明显的独特性状,并进一步阐明了形成这一独特性状的原因及发展过程,为促进地方良种猪遗传资源保护及发展进行了有益探索。 相似文献
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浦市铁骨猪(又称浦市黑猪)是湖南湘西自治州泸溪县浦市镇民间经过长期选育形成的地方品种,是湘西黑猪的一个重要类群,属肉脂兼用型,是我国猪种多样性的一个重要组成部分。文内对铁骨猪的来源、数量、群体结构、外貌、繁殖性能及研究开发前景等方面进行了初步总结,希望可以为今后铁骨猪的品种选育,扩繁,建立高产纯种核心群以及研究开发提供一些参考。 相似文献
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