微卫星DNA在动物亲子鉴定中的应用及研究进展

本文概述了微卫星DNA进行亲子鉴定的基本原理与方法,将其用于亲子鉴定的优点以及研究进展,最后对未来的应用进行了展望。     

绵羊(ATAG)n四碱基微卫星位点的筛选及其在亲子鉴定中的应用

本试验旨在筛选绵羊高度多态性四碱基微卫星遗传标记,建立适用于绵羊亲子关系鉴定的实验体系。试验以小尾寒羊为主要研究对象,从已有的绵羊参考基因组序列出发,基于全基因组序列筛选法共筛选出53个（ATAG）_n四碱基重复微卫星位点,然后通过基因分型数据共筛选出30个扩增效果好、多态信息含量（PIC）丰富的四碱基重复微卫星位点;30个位点的基因分型结果表明,共扩增出253个等位基因,平均等位基因数为8.433,等位基因数均>5,多态信息含量在0.566~0.898,观测杂合度（Ho）范围在0.548~0.903,期望杂合度（He）范围在0.631~0.921,平均期望杂合度为0.776;哈代-温伯格平衡检验30个位点均处于遗传平衡状态。随后根据PCR的扩增效率从获得的30个多态性位点中筛选出22个微卫星位点用于亲权排除概率的计算,根据多态信息含量的大小由高到低依次增加位点数进行组合。结果表明,在两个亲本的基因型均未知的情况下,标记位点数为15个时,累积排除概率可达到99.99%,其中单个位点的第一非亲排除率（non-exclusion probability of the first parent,NE-1P）介于0.321~0.663之间。利用建立的亲子鉴定体系对16只具有系谱记录的小尾寒羊样本进行检测,结果共鉴定出4个具有高置信度的绵羊家系,鉴定结果与系谱记录完全一致。本试验为绵羊分子系谱的构建、亲子鉴定以及保障绵羊育种工作的正常开展奠定重要基础。     

柏氏鲤与荷包红鲤抗寒品系杂交子二代的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）分子标记技术，对荷包红鲤抗寒品系与柏氏鲤进行杂交所获得的F2代个体进行亲子鉴定分析。从180个随机引物中筛选出5个多态性较丰富的引物，并对其产生的多态性DNA片段进行统计分析，结果显示：双亲的RAPD谱带全部在F2代中表现出来，而子代中产生的所有谱带在双亲中的表现率在AB02、AB05、AC20、AI10、AI13几个引物中分别为87．0％、100．0％、92．1％、82．8％、92．6％。这也表明BAPD技术在对鲤的亲子鉴定中具有很强的可行性。     

中国肉牛单核苷酸多态性个体识别体系构建

[目的]筛选一套能用于我国肉牛进行大规模亲子鉴定的SNP体系。[方法]运用HAPMAP数据结合文献寻找可用于我国肉牛亲子鉴定的SNP位点,筛选SNP位点及确定数目,运用相关公式计算其个体识别力和筛选结果的可信度。[结果]依据筛选标准共选择出38个符合标准的SNP位点,平均多态信息含量为0.364 5,平均观察杂合度为0.478 0。[结论]经分析38个SNP位点多态信息含量、个体识别力及累计个体识别力均符合等位基因数、杂合度、个体识别力等方面的要求,可用于我国大规模肉牛厂进行SNP个体识别鉴定需求。     

人工控制自然交尾条件下中国对虾父本的微卫星识别

人工控制自然交尾条件下,在保持中国对虾雌、雄5∶1的交配比率下,获得了两尾交尾并产生子代的雌虾,同时有4个疑似父本需要识别.利用3个微卫星引物及其组成的三重PCR技术对4个疑似父本进行了鉴别,准确的找到了相应的与雌虾交尾的雄虾.这为建立半同胞家系提供了一种新的技术和思路.     

基于微卫星标记建立翘嘴鳜亲子鉴定技术

利用9个多态性较高的微卫星标记对翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)进行亲子鉴定分析。结果显示,22个家系翘嘴鳜个体中共观测到95个等位基因,其观测杂合度和期望杂合度的平均值(范围)分别为0.578(0.219~0.800)和0.607(0.200~0.806),多态信息含量(范围)为0.552(0.187~0.787)。通过软件Cervus统计分析得到9个微卫星座位累计排除率为99.9658%,在27个可能的父母对条件下,混养养殖家系后代个体鉴定准确率为91%,研究结果表明筛选的这些多态微卫星分子标记可以用于翘嘴鳜优势家系的鉴定和分离,通过验证的微卫星标记建立的亲子鉴定技术为基础选育翘嘴鳜生长速度快的优势家系,为培育出生长速度快、抗病力强的翘嘴鳜新品种奠定基础。     

500株德保苏铁实生苗长势良好

经过DNA亲子鉴定和病虫害消杀处理的500株德保苏铁实生苗目前在广西德保县黄连山自然保护区长势良好。     

Paternity Testing of Selected Abaca （Musa textilis L. Nee） Hybrids Using Morphometric Markers

Investigation into the paternity of four abaca （Musa textilis L, Nee） hybrids was done to ascertain the mode of transmission of selected morpho-agronomic traits and to detect possible heterosis. In situ morphological characterization was undertaken using twenty five qualitative and six quantitative characters. Results revealed that a great majority of the qualitative traits were shared by both parents and their hybrids. For the rest, the qualitative traits were inherited from one or the other parent though some variant phenotypes （i.e. chimerism） were also noted in the hybrids. Cases ofheterosis were also observed and this could be exploited to increase fiber yield in the hybrids. Though inconclusive due to factors such as the heterogenous nature of abaca plants in the field and the susceptibility of morphological traits to environmental fluctuations, this study has provided baseline information on abaca hybridity that can be verified using more robust technologies as molecular markers.     

微卫星DNA标记在番茄亲子鉴定中的应用

采用242对微卫星DNA标记引物分析了29份番茄自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的34对引物,34对引物的平均等位基因数为4.53,平均多态信息量(PIC)为0.514 1,累积鉴别力(CDP)达0.999 999.利用其中的11对SSR引物对杂交种‘浙杂210’、母本‘01-199-1-1-0’及7个...