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1.
基于iTRAQ质谱分析技术筛选南方型紫花苜蓿根部响应盐胁迫差异表达蛋白 总被引:3,自引:0,他引:3
为了从蛋白质水平上揭示南方型紫花苜蓿(Medicago sativa ‘Millennium’)适应盐胁迫的分子机制,本研究以30 d苗龄的南方型紫花苜蓿实生苗为材料,分析正常培养和250 mmol/L NaCl处理72 h后根中的蛋白表达变化,采用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)结合双向液相色谱与串联质谱(2-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2D-LC-MS/MS)定量蛋白质组技术鉴定南方型紫花苜蓿根部响应盐胁迫差异表达蛋白,对所获得差异蛋白进行生物信息学分析,筛选出可能耐盐潜在靶标蛋白.同时,选择5个差异表达蛋白进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证.结果表明,共鉴定3 857种定量蛋白,534种差异蛋白(变化倍数≥1.2,P<0.05),其中表达上调的281种,表达下调的253种.基因本体(Gene Ontology,GO)分子功能提示这些差异性蛋白主要参与转运活性、催化活性和酶调控活性.京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路显著性富集于代谢途径、次生代谢产物生物合成、苯丙氨酸代谢和核糖体等(P< 0.05,错误发现率(false discovery rate,FDR)< 0.05).成功鉴定的差异蛋白分别涉及到信号传递(8.99%)、抗氧化物(7.68%)、防御(5.61%)、蛋白质合成、加工和降解(14.79%)、能量产生与转运(5.81%)、代谢(26.97%)、膜与胞内运输(5.62%)和细胞结构、分裂和细胞骨架(2.06%)等.差异表达蛋白中与信号传递、抗氧化物和防御等相关的蛋白表达量总体上调,而与代谢和能量产生与转运相关蛋白表达量总体下调.qRT-PCR实验发现,mRNA与蛋白质表达水平并不一致.研究发现组氨酸磷酸转移蛋白、丝裂原活化蛋白激酶、h类硫氧还蛋白、蛋氨酸亚砜还原酶基因、鸟苷二磷酸(guanosine diphosphate, GDP)解离抑制因子、脂质转移蛋白、β-1,2-木糖基转移酶和H2A/H2B/H3/H4核心组蛋白等可能是紫花苜蓿耐盐潜在靶标蛋白.本研究采用iTRAQ结合2D-LC-MS/MS技术,有效地筛选出南方型紫花苜蓿根部响应盐胁迫差异表达蛋白,为深入认识紫花苜蓿盐胁迫的应答分子调控机制奠定了坚实的基础. 相似文献
2.
本项研究对雏鸡感染传染性法氏囊病毒(IBDV)后,1~8周外周血液的 ANAE~+淋巴细胞(T 细胞)、淋巴细胞和白细胞数量的动态变化进行了检测。结果表明,1日龄雏鸡感染 IBDV 后,其血液中 ANAE~+,淋巴细胞数量明显低于对照雏鸡,表明其细胞免疫机能降低;4周龄雏鸡感染 IBDV 后,其 ANAE~+淋巴细胞数量呈一过性降低,变化不如1日龄感染雏鸡明显,说明 IBDV 对雏鸡存在感染年龄差异;对 ANAE~+淋巴细胞绝对数的检测较百分比能更真实地反映 IBD 鸡的细胞免疫功能变化的实质。 相似文献
3.
研究羽叶决明(Chamaecrasta nictitans)代木栽培鸡腿菇(Coprinus ovatus)对其绝对生物学效率、基物失重、呼吸消耗及木质纤维素转化的影响.结果表明,羽叶决明牧草替代60%木屑(A60)栽培鸡腿菇的绝对生物学效率最高,均为10.77%.覆土前和采收后的基物失重和呼吸消耗都以A0(CK)为最高,分别为11.47%、11.47%和31.75%、25.55%,其木质素转化率也最高,为79.21%;纤维素转化率以A100(羽叶决明牧草替代100%木屑)为最高,达50.93%;半纤维素转化率以A40(羽叶决明牧草替代40%木屑)为最高,为49.74%.回归分析结果表明,绝对生物学效率和半纤维素转化率与替代比例呈抛物线相关,而基物失重、呼吸消耗及木质素、纤维素转化率与替代比例呈线性相关. 相似文献
4.
唐晓弟 《中南林业科技大学学报(自然科学版)》1995,(1)
本文讨论了在合成运动中,动点与动参考系的选取,相对运动轨迹对计算点的绝对速度和绝对加速度的影响.证明了相对运动轨迹只对点的绝对加速度计算有影响,阐明了选取动点和动参考系的原则. 相似文献
5.
落叶松生长率测定方法的探讨 总被引:1,自引:0,他引:1
落叶松生长率是落叶松资源档案管理的重要资料,其测定方法较多,笔者认为,用复利式生长率比用普雷斯勒式生长率更接近实际值,可达到要求的精度,并可保持计算的系统性。笔者还认为,区分立地条件测定龄级带皮材积复利生长率的方法,比区分立地条件测定龄组去皮材积生长率的方法更科学、实用性更强、使用范围更广,前者可为基地化、规模化栽培落叶松速生丰产林提供科学依据。 相似文献
6.
7.
应用iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术分析草菇同核和异核菌丝蛋白质组 总被引:1,自引:0,他引:1
首次利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合二维液相色谱串联质谱对草菇(Volvariella volvacea)同核和异核菌丝蛋白质组进行研究。采用QExactive质谱鉴定并经MASCOT软件搜库,对所有鉴定蛋白进行主成分分析(principal component analysis,PCA)、层次聚类(hierarchical clustering)分析和GO(gene ontology)注释,并进行生物信息学分析。结果共获得2335个不同肽段,鉴定到1039个蛋白,其中1030个蛋白具有定量信息。在同核菌丝中显著上调蛋白83个,下调蛋白97个,表明iTRAQ标记技术结合二维液相色谱串联质谱可有效地分离和鉴定草菇菌丝蛋白质组。该研究结果为更深入全面地研究草菇菌丝蛋白质组学奠定基础。 相似文献
8.
张云涛 《四川畜牧兽医学院学报》2008,(3):89-91
考察现代神学之父施莱尔马赫的自我意识理论,发现在他那里,情感(直接的自我意识)主要有三层含义:道德觉察、为各种能力奠基的综合活动以及对无限者的把握。通过阐释后两层含义及它们的关系,来探讨施莱尔马赫自我意识理论的贡献及其局限,并寻求可能解决的途径。 相似文献
9.
Summary Salt tolerance in pepper (Capsicum annuum L.) is described in terms of yield, mortality and root weight. Significant differences in absolute and in relative salt tolerance were demonstrated between Tunisian varieties. Relative salt tolerance of Beldi was found to be due to its root system which remained unreduced under stress condition; local adaptation could be involved. D'hirat showed interesting levels of absolute salt tolerance and low mortality. An ECw-value \s-> 7.63 dS/m was critical for almost all characters observed, with reductions of approximately 50%. Fruit weight and shoot-root ratio were not significantly affected by high salt concentrations of the irrigation water. 相似文献
10.
农作物区域比较优势分析--以江苏省淮安市淮阴区为例 总被引:2,自引:0,他引:2
以产量优势指数为比较优势计量指标,分析了江苏省淮安市淮阴区主要的8种农作物在1995~2000年间产量在国内和省内绝对优劣势的变动情况,发现除个别作物的产量绝对优劣势随着时间的推进在个别时期会发生较大的变化外,多数作物的产量绝对优劣势基本保持相对稳定。根据该8种农作物在1995~2000年间的产量优势指数均值及其相对优势排名,还对产量国内和省内比较优势进行了对比分析,结果表明相对于不同高层次区域,作物的比较优势会表现出较大的差别。 相似文献