五指山、二花脸和皮特兰猪的SLA-DQB基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析

采用PCR-RFLP法对五指山猪、二花脸猪及皮特兰猪的SLA-DQB基因外显子2的PCR产物进行了分析,结果显示,SLA-DQB基因外显子2经限制酶HaeⅢ和RsaⅠ酶切共分出9种RFLP组合带型,五指山猪、二花脸猪和皮特兰猪分别有3种、3种和5种组合带型.Hardy-Weinberg平衡分析表明,五指山猪和二花脸猪的SLA-DQB基因外显子2的两个酶切位点的PCR-RFLP带型达平衡状态,而皮特兰猪中只有RsaⅠ酶切位点达到平衡状态.     

苏太猪SLA-DQB基因外显子2多态性及其与繁殖性能的关联分析

采用PCR-RFLP法对苏太猪SLA-DQB基因外显子2的PCR产物进行分析,结果显示,SLA-DQB基因外显子2经RsaⅠ酶切后,共分出4种基因型;经HaeⅢ酶切,共分出3种基因型。χ^2适合性检验结果表明,苏太猪SLA-DQB基因外显子2在RsaⅠ和HaeⅢ酶切位点都已经达到了Hardy-Weinberg平衡状态。在RsaⅠ和HaeⅢ酶切后分出的4种组合带型中,组合带型为BBEE的种母猪第3胎总产仔数、产活仔数、初生窝重、断奶仔猪数和断奶窝重均显著高于组合带型为AADD的个体（P〈0.05）,也高于组合带型为ABDE和ACDE的个体,但是差异不显著（P〉0.05）。     

苏太猪SLA-DQB和SLA-DRB基因第2外显子多态性及其与繁殖性能的关联分析

采用PCR-RFLP技术对苏太猪SLA-DQB及SLA-DRB基因第2外显子PCR产物进行分析。结果表明,苏太猪SLA-DQB基因经RsaⅠ酶切后共产生3种等位基因,5种基因型;SLA-DRB基因经RsaⅠ酶切后共产生3种等位基因,4种基因型。χ2适合性检验表明,苏太猪SLA-DQB及SLA-DRB基因外显子2的RsaⅠ酶切位点均达到了Hardy-Weinberg平衡状态。将SLA-DQB和SLA-DRB基因的基因型进行组合,共产生12种组合基因型,BBDF的第3胎繁殖性能总产仔数、产活仔数、初生窝重和断奶仔猪数显著高于组合基因型AADD、AADF、ABDD和CCDF(P<0.05)。从繁殖性能看,BBDF在群体中为最优秀的组合基因型。     

烟台黑猪SLA-DQB基因外显子2多态性及其与仔猪腹泻的关联分析

采用PCR-RFLP方法对烟台黑猪DQB基因外显子2的多态性进行研究,并对该位点与仔猪腹泻的关联进行了分析。结果表明,在烟台黑猪DQB基因外显子2上共检测出4种等位基因(A、B、C、D),7种RFLP带型(AA、BB、CC、AB、AC、BC、AD),该位点具有较丰富的多态性。卡方适合性检验显示,烟台黑猪的DQB基因外显子2没有达到Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。最小二乘法分析结果表明,烟台黑猪的性别和DQB外显子2的基因型均对仔猪腹泻无显著影响(P>0.05),而性别与基因型的互作效应对仔猪腹泻具有极显著的影响(P<0.01),在公猪群体中,AD基因型仔猪腹泻评分高于AA基因型个体(P<0.05),在母猪群体中BB、AC、BC、CC基因型仔猪腹泻评分高于其他基因型仔猪(P<0.05)。     

广西巴马小型猪SLA-DQB 基因 的克隆及序列分析

利用RT-PCR 的方法从广西巴马小型猪肝脏组织中扩增SLA-DQB 基因的编码区序列,旨在为下一步构 建SLA-DQB 转基因广西巴马小型猪奠定基础。结果表明,克隆的广西巴马小型猪SLA-DQB 基因编码区长687 bp,与 GenBank 参考序列（NM_001113694）相比,共有15 个氨基酸发生突变（位点为10、14、19、27、29、38、39、48、58、61、68、 72、76、78、183）。与普通猪、其他小型猪、奶牛、人类及小鼠的同源性分别为95.8%、95.8%、88.1%、86.2%和80.0%。     

荣昌猪SLA-DQB基因β1结构域突变分析及蛋白质序列模式预测

为了深入了解荣昌猪SLA DQB基因β1结构域的变异及蛋白质序列模式分布情况,对53头荣昌猪SLADQB基因的β1结构域进行了克隆测序和序列多重比对,并在线预测蛋白质序列模式.结果发现,222 bp区域内存在9个单核苷酸的插入位点、16个单核苷酸的缺失位点和89个SNPs位点.74个氨基酸中仅由SNP位点导致的氨基酸变异位点共37个,其中有24个位点氨基酸的类型发生变化.对50条SLA- DQB基因β1结构域蛋白质序列分析发现7种类型共174个蛋白质序列模式位点.单条序列中蛋白质序列模式位点最多的12个,最少的2个.蛋白质序列模式突变位点主要发生在第9、26、45、53、61个氨基酸上,涉及到5种类型蛋白质序列模式位点的改变.结果提示,荣昌猪5L A- DQB基因β1结构域存在丰富的遗传变异和多样化的蛋白质序列模式.     

撒坝猪及长撒二元杂猪SLA-DQB基因PCR-RFLP多态性分析

采用限制性内切酶RsaⅠ对云南地方品种撒坝猪及其长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2的273bp扩增产物进行多态性分析,结果在2种猪中均发现B、C、G3种等位基因,在撒坝猪中发现6种基因型:132bp/84bp/30bp/27bp(BB)、246bp/27bp(CC)、132bp/114bp/27bp(GG)、246bp/132bp/84bp/30bp/27bp(BC)、132bp/114bp/84bp/30bp/27bp(BG)、246bp/132bp/114bp/27bp(CG);长撒二元杂猪中发现5种基因型:BB、CC、BC、BG、CG。经χ2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2在RsaⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传不平衡状态。