Molecular identification and genetic analysis for 24 turf-type Cynodon cultivars by Sequence-Related Amplified Polymorphism markers

Bermudagrass (Cynodon ssp.) germplasm is genetically diverse and widely distributed in the world. The study was conducted to identify and assess the molecular variation and relationship among 24 cultivars developed in China, Australia and the USA. Sequence-Related Amplified Polymorphism (SRAP) was applied to cultivars identification in this study for the first time. Thirty of the 90 SRAP primer combinations generated a total of 274 clearly bands encompassing 249 (91%) polymorphic. Each bermudagrass cultivar has its unique binary code and can be distinguished from the others. Three distinct clusters were obtained by unweighted pair-group method with arithmetic averages based on the polymorphic markers. Coefficients of genetic distance among the genotypes ranged from 0.57 to 0.97. The results demonstrated that SRAP marker is a stable molecular marker technique for the identification of bermudagrass cultivars and their genetic relationships.     

巴西橡胶树TCTP基因结构分析及分子标记开发

翻译控制肿瘤蛋白(translationally controlled tumour protein,TCTP)是生物体中一种普遍存在且高度保守的蛋白.作为一种多功能蛋白,TCTP在各种复杂的生命活动中发挥重要作用.本研究根据已知的HbTCTP cDNA序列设计引物,对PCR扩增产物测序获得HbTCTP基因组序列.比对HbTCTP基因组和cDNA序列发现HbTCTP由4个内含子和5个外显子组成,内含子与外显子剪接处符合GT/AG法则.根据HbTCTP序列及基因结构信息开发简单重复序列(SSR)和内含子长度多态性(ILP)标记,并在10个橡胶树品系中分析SSR和ILP标记多态性.结果表明,SSR和ILP标记在10个橡胶树品系中均出现多态性,多态性分别由SSR重复次数多少和内含子长短引起.     

DNA分子标记技术的研究与应用

DNA分子标记是继传统的形态学标记、细胞学标记、生化标记之后发展起来的以DNA为基础的遗传标记技术,因其独有的技术特点,迅速在各领域得到广泛的应用与发展。本研究总结概括了基于m RNA的表达序列标签(ESTs)、差异显示逆转录PCR (DDRT-PCR)、特征性差异分析(RDA)、基因表达系列分析(SAGE);基于目的基因的保守DNA衍生多态性(CDDP)、目标起始密码子多态性(SCoT)、保守区域扩增多态性(Co-RAP)和基于反转录转座子的反转录转座子位点间扩增多态性(IRAP)、反转录转座子-微卫星扩增多态性(REMAP)等几种新型DNA分子标记技术的原理、特点、优缺点,以及常见DNA分子标记技术的特点比较及其应用,以期在其基础上推动分子标记技术进一步融合、创新与发展。     

宁夏六盘山区黄牛杂交改良群体GHR基因多态性分析（摘要）

[目的]对宁夏六盘山区黄牛杂交改良群体生长激素受体（GHR）基因的多态性进行分析,为宁夏黄牛杂交改良选育提供理论参考。[方法]采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法（PCR-RFLP）,对该群体70个个体的GHR基因多态性进行检测。[结果]扩增出338bp的目的片段,PCR产物被限制性内切酶AluI消化后表现出多态性,其中AA基因型频率为75.71%;BB基因型频率为24.29%。[结论]共检测到AA和BB2种基因型,六盘山区黄牛杂交改良群体GHR基因具有多态性。     

金水乌鸡PRL基因多态性研究

[目的]研究金水乌鸡PRL基因多态性,为金水乌鸡的保种和持续选育与提高积累分子基础数据。[方法]采用PCR-RFLP方法研究金水乌鸡白羽丝毛系165只乌鸡PRL基因多态性,分别采用HaeⅢ和HhaⅠ2种内切酶对各DNA样品的PCR产物进行单酶切,分析基因型与产蛋数的相关。[结果]金水乌鸡PRL基因的PCR产物的HhaⅠ酶切片段未出现多态性。金水乌鸡PRL基因的PCR产物的HaeⅢ酶切片段呈现RFLP多态性,有AA、AB、BB3种基因型,A基因频率较高。相关分析结果表明,不同基因型的产蛋数差异不显著。[结论]A基因可能是影响产蛋数的优势基因。     

猪乳中一组高分子量蛋白的多态性及其与繁殖性能关系的研究

采用十二烷基硫酸钠 聚丙烯酰胺凝胶不连续垂直板电泳 (SDS PAGE)对 16 2头二花脸母猪乳中一组高分子量蛋白质 (HMWP)进行了检测 ,计算了该位点的基因型频率、等位基因频率和遗传多样性指数等 ,并运用线性模型统计方法分析了该位点的不同基因型与母猪繁殖性能的关系。结果表明 ,在二花脸猪种群 ,乳中HMWP存在B(M :11480 0± 40 0 )和D(M :10 140 0± 6 0 0 )两种带 ,分别受二个等位基因HB 和HD 控制。BB、BD和DD三种基因型频率分别为 0 6 6 6 7、0 2 716和 0 0 6 17,两个等位基因HB 和HD 频率分别为 0 80 2 5和 0 1975 ,遗传多样性指数为0 3170。在三种HMWP基因型中 ,不同基因型母猪的繁殖性能在活仔数和窝重上存在着显著差异 (P <0 0 5 ) ,但在初生仔猪个体重和 2 0日龄窝重上未达到显著水平 (P >0 0 5 )。     

猪IGFBP2基因多态性及其与胴体、肉质性状的关联分析

本研究旨在调查猪胰岛素样生长因子结合蛋白2基因(IGFBP2)潜在的变异与胴体性状和肉质性状之间的关系。IGFBP2是IGFBPs家族的一员,定位在猪15号染色体上。本研究利用PCR-MspⅠ-RFLP方法对该基因第二内含子g.171CT(Gen Bank Accession No.BV727778)进行了单核苷酸多态性(SNP)检测,在382头大白×梅山猪F2代猪群体中关联分析。结果发现该位点与背膘厚、眼肌高、眼肌宽、骨率等性状呈极显著相关(P0.01),与眼肌面积、肥肉率、瘦肥比、花油、色值(LD)和色值(BF)等性状呈显著相关(P0.05)。结果表明IGFBP2基因型与胴体和肉质性能存在一定程度的显著关联,是潜在的影响猪胴体和肉质性状的候选基因。     

乐都山羊红细胞钾型的研究

采用火焰光度法对７５只乐都山羊的红细胞钾型进行了调查研究。结果发现：①按红细胞钾浓度，乐都山羊有高钾和低钾两种表型，以高钾为优势表型（８８％）；②高钾型山羊的红细胞钾浓度在４３．５９￣８１．３０ｍｍｏｌ／Ｌ之间，低钾型的在９．３７￣２１．２１ｍｍｏｌ／Ｌ之间；③Ｋ＾ｈ和Ｋ＾Ｌ等位基因频率分别为０．９３８７和０．０６１９，基因杂合度为０．１１６１。     

新吉细毛羊5个生殖激素受体基因多态性分析

本研究旨在检测新吉细毛羊促性腺激素释放激素(GnRHR)、促黄体素(LHR)、促卵泡素(FSHR)、催乳素受体(PRLR)、雌激素(ESR)5个生殖激素受体基因多态性,为绵羊繁殖力的标记辅助选择和育种提供理论依据。以119只新吉细毛羊个体为研究对象,利用ABI测序仪检测基因多态性;用DNASTAR软件与I-TASSER软件预测蛋白质三级结构;用Excel计算基因型频率;用GraphPad prism 6软件进行新吉细毛羊群体5个生殖激素受体基因多态性与产羔数的相关性分析。经测序分析发现,FSHR基因不存在突变位点,其余4个基因存在13个突变位点。GnRHR基因存在A505G、G720C突变,LHR基因存在T1262G、A1991G、C2012T、A2032T、T2041A的突变,PRLR基因存在A1263G、C1544G突变,ESR基因存在A106T、C181T、G612A、C735T突变。在新吉细毛羊群体4个基因多态性与产羔数相关性分析结果中,只有ESR基因A106T突变对新吉细毛羊产羔数影响显著。其中AA、AT、TT 3种基因型个体的平均产羔数分别为1.391、1.101、1.417。AA基因型、TT基因型平均产羔数比AT基因型分别多0.290、0.316个(P<0.05)。AA基因型、TT基因型平均产羔数之间差异不显著(P>0.05)。     

甜菜SCoT核心引物的筛选

【研究目的】为了筛选出适合甜菜品种遗传多样性分析的SCoT引物,为SCoT引物得以在甜菜中进行深入应用奠定基础,本研究甜菜以8个来自不同国家的甜菜品种为材料对80条SCoT引物进行扩增【方法】扩增方法采用SCoT-PCR最优反应体系包含2.0 μL的10×PCR buffer（含Mg2+）、10 ng的DNA、0.5 U的Taq DNA聚合酶、10 μmol/L的引物2 μL以及0.1 μL的dNTPs (2.5 mmol/L each)。【结果】结果从80条SCoT引物中筛选出20条多态性高的引物,这20条引物最多扩增出16条多态性条带,最少扩增出2条多态性条带,扩增总条带155条,其中多态性条带为134条,多态性条带的百分比为86.5%。【结论】通过对核心引物的有效性验证,表明筛选出的20个核心引物非常适合用于甜菜指纹图谱的构建。