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刘起丽 《农业生物技术学报》2014,(1)
正小的环状单链DNA病毒容易被扩增、克隆和测序,这大大加快了公用数据库里玉米线条病毒序列增加的速度。目前划分玉米线条病毒种的标准已重新确定,但该标准很难应用于大量序列数据。近年来由于缺乏严格的标准化分类方法,导致出现了越来越多有问题的玉米线条病毒种的提议。为了解决这个问题,南非开普敦大学传染病和分子医学研究所计算生物学研究小组的Brejnev Muhire及其合作成员通过大量的序列比对和程序研发工作,提出了一套基于全基因组两两相似性比对的玉米线条病毒属病毒分类标准,同时开发了可以计算和绘图的开放式计算机程序SDT(种的界定工具),其相关研究结果近期发表在《Archives of Virology》上。 相似文献
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