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1.
为了丰富紫花槭转录组数据,进一步开展紫花槭秋季叶片呈色机制研究.本研究以紫花槭秋季转色期三个阶段(前期,中期,后期)叶片为材料,采用高通量测序技术进行转录组初步分析.转录组数据共获得50501条Unigene,有35316条Unigene在数据库中得到注释,其中NR数据库中注释到的Unigene数量最多,共35024条,占69.4%.在注释到的物种中,紫花槭比对的Unigene与甜橙(Citrus sinensis)相似度最高,共有4290条,占12.25%.紫花槭转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物学过程、细胞组分和分子功能3大类,共有25375条,其中生物学过程的基因最多,主要聚集于代谢过程和细胞过程等.基于Unigene库的基因结构分析,其中SSR分析共获得12711个SSR标记,占Unigene总数的36%.SSR位点共包含150种重复基元,单碱基重复所占比例最高(7184个,61.86%),四碱基重复、五碱基重复和六碱基重复所占比例较低.Unigene库中共有328239个SNP位点,发生频率为1/190 bp,SNP位点分为转换和颠换两种类型的碱基替换方式,其中碱基转换位点213787个(65.13%),碱基颠换位点114452个(34.87%),碱基转换类型发生频率高于颠换类型.6种单碱基变异中,2种转换类型A/G、C/T的发生频率分别为33.03%和32.10%;4种颠换类型中A/T发生频率最高,为11.52%;C/G发生频率最低,为5.79%.紫花槭转录组秋季叶色表达的转录组分析,可为紫花槭叶色基因调控、定向分子育种和培育彩叶新品种提供研究提供基础的数据信息. 相似文献
2.
副猪嗜血杆菌临床分离菌的药物敏感性试验与ERIC-PCR基因分型 总被引:1,自引:0,他引:1
从河南、湖北等7个省份的323份疑似副猪嗜血杆菌(HPS)典型病料中分离获得HPS菌104株。对这些分离菌株进行了16s RNA鉴定,用微量肉汤稀释法观察了这些菌株对12种抗菌药物的敏感性,并用ERIC-PCR方法对分离菌进行了基因分型。结果表明:所有菌株都对痢菌净和沃尼妙林敏感,对复方磺胺-5-甲氧嘧啶钠、四环素、环丙沙星、林可霉素、卡那霉素、甲砜霉素、红霉素、氨苄西林、头孢噻呋和头孢喹肟的耐药率分别为93.3%、51.9%、51.0%、26.0%、10.6%、13.5%、37.5%、39.4%、5.8%和1.9%;大多数菌株耐2~5种抗生素,所占比例达到69.2%;在104株分离株中有99株可以进行ERIC-PCR分型,按80%的相似性可分为18个ERIC-PCR谱型;包含菌株最多的谱型为型,有25株;其次依次为Ⅵ、Ⅷ、Ⅸ、Ⅶ型,分别有18、13、13、9株;除耐林可霉素的菌株较均匀地分布于12个ERIC-PCR型外,耐其它5种药物的菌株大多集中分布于2~3个ERIC-PCR型中。 相似文献
3.
促卵泡生成素受体基因的SNP对牛双胎性状的标记研究 总被引:5,自引:0,他引:5
以秦川牛和荷斯坦奶牛的双胎母牛和单胎母牛为实验材料,以牛的FSHR基因的第10个外显子作为标记牛双胎性状的候选基因,用SNP法进行了多态检测。结果发现,在秦川牛的双胎母牛中突变率为60%(6/10),而在单胎母牛中突变率为20%(2/10);在荷斯坦奶牛中,双胎母牛突变率为31.25%(5/16),单胎母牛突变率为6.67%(1/15);由此可见双胎牛和单胎牛二者之间FSHR基因的第10个外显子的突变率差异明显。这表明选择FSHR基因的10个外显子有可能作为双胎性状的候选基因。经序列分析发现在FSHR基因的第1506个碱基发生了突变(T→C),但氨基酸没有发生变化。 相似文献
4.
猪传染性胸膜肺炎血清抗体检测 总被引:18,自引:2,他引:16
应用间接血凝试验对来自甘肃、陕西、宁夏、河南、湖北、湖南和海岛7个省(区)的1470份猪血清进行猪传染性胸膜肺炎血清抗体检测和分型鉴定。结果猪传染性胸膜肺炎平均抗体阳性率为20%。其范围为0-60%;分型鉴定表明,各省(区)的血清型不尽相同,主要为1、3、7型。 相似文献
5.
猪MHC I类区域基因及其分型研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
猪MHCI类区域的基因可分为Ia,Ib及Ic三类基因,其中Ia共发现7个基因,Ib为3个,Ic为2个,不同类型的基因有着相似的结构,具有不同程度的同源性。对I类基因分型,血清学分型共得到74个单倍型,分子学分型结果变化较大,其中有一个已分为7个血清学型的I类等位基因,经特定酶切后确认得到了7个等位基因的图谱。 相似文献
6.
祖国医学认为“风寒湿三气杂至 ,合而为痹”。痹症是经络不通 ,气血闭阻引起的一些痛症 ,它包括现代医学中的类风湿性关节炎、风湿性关节炎、强直性脊柱炎、痛风性关节炎等疾病。临床上病程长、疗效慢 ,很难治愈。李万瑶教授不循常法 ,将传统的蜂螫疗法与祖国医学的经络腧穴理论相结合 ,对痹症的治疗取得较好的疗效。现将其治验小结如下。1 辨证分型根据临床表现何邪偏胜可分为 4症 :行痹 :肢体关节走窜疼痛 ,此起彼伏 ,痛无定处。有时兼见寒热 ,舌黄腻苔 ,脉浮滑。此为风气偏盛所致。痛痹 :畏寒 ,关节疼痛较剧烈 ,或酸胀疼痛 ,遇寒加重 ,… 相似文献
7.
8.
9.
猪多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及生物学特性研究 总被引:17,自引:2,他引:17
用PCR方法配合生化鉴定,从有肺炎症状猪的肺脏及进行性萎缩性鼻炎(Progressive atrophic rhinitis,PAR)症状猪的鼻拭子中分离出66株多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)。然后做了药敏试验,并用PCR方法对这66株Pm进行分型及毒素基因的检测,用豚鼠皮肤坏死试验及小鼠致死试验对产毒素多杀性巴氏杆菌(Toxigenie Pasteurella multocida,T^ Pm)进一步鉴定。结果显示PCR鉴定与生化鉴定Pm结果完全一致;PCR分型表明有46株为D型Pm,18株为A型:Pm,1株为B型Pm,1株无法定型;有8株用PcR检测为T^ Pm;豚鼠皮肤坏死试验及小鼠致死试验对这8株T^ Pm的进一步鉴定也表明均为产毒素菌株。所鉴定的8株T^ Pm都为D型,都分离于有严重PAR症状的猪。 相似文献
10.
遗传标记及其在家禽育种中的应用 总被引:1,自引:1,他引:1
1 SNP SNP是染色体中遗传变异的最普通形式,如在人体已经检测基因组DNA中每1,000到2,000个单位有1个SNP,在某些区域估计每300个单位有一个SNP.基于SNP的高分辨率,遗传图谱在一些人的染色体上通常没有得到发展.正如其名称所指,SNP是发生在基因(启动子、外显子、或内含子)或基因之间(基因间隔区)的单个碱基改变或核苷酸变异.编码序列中的SNP以同义(不会导致氨基酸改变)或非同义(导致氨基酸改变)来分类.非同义SNP由于对蛋白质表达及最终对表现型的潜在影响而受到重视.相反,同义SNP可能对基因表达有微小的影响(除那些在启动子和其它基因组区域中,对DNA-蛋白质作重要的核苷酸或与RNA稳定性有关的核苷酸).同义和非同义SNP在基因图谱研究中均是很好的遗传标记. 相似文献