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1.
杂草稻nrDNA ITS片段的PCR扩增条件优化及测定 总被引:1,自引:1,他引:0
对杂草稻的nrDNA ITS片段的PCR扩增条件进行了优化并测定,建立的PCR最优体系为:20μL反应体系含1μL模板DNA,0.125mmoL/L dNTPs,0.5μmol/L正反向引物,1U Taq酶,2.0μL 10×Taq PCR Bufter;退火温度为57℃。这样的条件下充分保证了ITS PCR产物的质量和纯度要求,直接测序结果为600bp左右,与网上结果十分类似,表明结果准确可靠。这些ITS片段的系统学信息将为杂草稻的起源进化提供有力的分子水平证据。 相似文献
2.
设计植物EXP扩展蛋白简并引物,以砂梨果实cDNA为模板,克隆得到EXP基因cDNA片段,该片段长465 bp。根据该片段序列,分别设计2条5’和3’末端扩增的特异引物,利用RACE技术,获得了该片段的5’端和3’端序列。用DNAMAN5.22软件对3个序列进行拼接和分析,获得了该基因的cDNA全长,命名为Pyp-EXP。该cDNA全长为1 395 bp,5’端起始密码子ATG始于72 bp,3’端终止子TAG止于830 bp,Ploy+(A)从1 363~1 395 bp。该基因已在GenBank基因数据库注册,注册号为EF602031。Pyp-EXP核苷酸序列有一个759 bp完整的开放阅读框,编码区与西洋梨、苹果、湖北海棠、桃的同源性分别为96%,96%,94%和86%;该cDNA推导编码252个氨基酸,含有1个组氨酸(His_Phe_Asp,HFD)功能域,与西洋梨、苹果、湖北海棠、桃中相应序列同源性分别为98%,97%,95%和93%。该基因的克隆为研究扩展蛋白的时空表达及其在果实发育和成熟过程中的作用奠定了基础。 相似文献
3.
禽流感病毒HA基因的分子克隆和测序 总被引:14,自引:0,他引:14
血凝素(HA)是禽流感病毒诱导机体产生保护性体液免疫反应的主要靶抗原。本研究的目的是克隆HA基因,为以后的表达及基因工程疫苗的研制奠定基础。收获接毒鸡胚的尿囊液,超速离心沉淀病毒,采用异硫氰酸胍法提取病毒RNA,利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术扩增出禽流感病毒(H9N2亚型)血凝素的cDNA。PCR产物加A尾后,用玻璃奶试剂盒回收纯化目的片段,通过T-A连接将加尾PCR产物连接到线状克隆载体pGEM-T easy vector,转化DH5α感受态细胞,在含氨苄青霉素的LB平板上筛选阳性克隆,提取质粒,经酶切鉴定,对目的片段进行测序,结果获得了HA基因全长,约1.7kb,与已知序列进行同源性比较,同源性最高的可达97%,所克隆的基因为禽流感HA基因工程疫苗的研究奠定了基础。 相似文献
4.
伪狂犬病病毒上海株gE和gI基因的克隆及序列分析 总被引:2,自引:0,他引:2
参考Genebank发表的伪犬病病毒(Pseudorabies Virus,PRV)的gI和gE基因序列,自行设计并合成了两对引物,对PRV上海株(PRV-SH)进行PCR扩增,产物经琼脂糖电泳分析,均呈现一条约960bp和1740bp的条带,将其克隆入pGEM-T-easy载体中,进行了序旬测定,将PRV-SH株的gI基因与Rice株gI基因比较发现,核苷酸的同源性为94.7%,氨基酸的同源性为91.3%,证实为gI基因,将PRV-SH gE基因序列与Ea株、Ruce株gE基因序列进行比较,结果显示,该序列与PRV Ea株、Rice株gE基因的同源性分别为98.5%、97.5%;的氨基酸序列与Ea株,Rice株和I型单纯疱疹病毒(HSV-1)17株gE的同源性分别为97.2%、94.8%和15.6%。 相似文献
5.
狂犬病病毒SRV9克隆株核蛋白基因的克隆、表达与特性分析 总被引:4,自引:0,他引:4
根据已发表的狂犬病病毒核蛋白基因序列,设计并合成了一对引物,从SAD株驯化的SRV9。蚀斑株中提取病毒RNA,通过RT-PCR扩增出核蛋白的全长cDNA序列,测序结果显示,其序列与国外报道的SAD母源株序列一致。将核蛋白的cDNA克隆至原核表达载体pET-28b( )中,转化大肠杆菌BL21(DE3)plyss,于30℃1mmol/LIPTG条件下诱导表达,大肠杆菌菌体裂解产物经SDS-PAGE分析,在分子量约为56kDa处出现一新的蛋白带。和预期的目的蛋白分子量相符,Western-blotting检测表明,表达产物能与狂犬病病毒阳性血清发生特异性反应,出现单一反应带,扫描分析显示,表达产物占菌体总蛋白的23%,包涵体分离,纯化后,纯度达89%,上述结果为核蛋白在狂犬病基因免疫和免疫检测中的进一步应用奠定了基础。 相似文献
6.
猪具有独特的生物学特征,在畜牧业生产和医学研究中占有重要地位。全基因组测序即de novo测序和全基因组重测序为解释猪的生物学特性和促进猪的分子育种发挥了重要作用。本文重点阐述全基因组测序在猪基因组学研究中的应用,分析全基因组测序技术及其在猪的全基因组测序工作中的优势和不足,并对未来猪的分子遗传育种研究工作进行展望。 相似文献
7.
In this paper, we report molecular investigation of an ectomycorrhizal fungi (EMF) community of European larch (Larix decidua Mill.) seedlings grown in a bare-root nursery. In total, we surveyed 32 nurseries that were each active in supplying planting stocks to restock forests and for afforestation of post-agricultural land. Sequence-based approach was used to identify EMF taxa, quantify EMF richness, and document differences in the relative abundance of individual taxa. We identified seven fungal species that might contribute to the mycorrhizal community structure of 1 to 3-year-old L. decidua seedlings. The species richness in the examined larches varied between one and four fungal taxa, depending on both the nursery stock samples (NSS) and age class of the seedlings. The average was 1.4 for 1-year-old seedlings and 2.3 for 2- and 3-year-old plants. The dominance of Ascomycota over Basidiomycota and the prevalence of two species, Wilcoxina mikolae and Suillus grevillei, as EMF partners were characteristic features of nursery-grown L. decidua seedlings. S. grevillei was the only one basidiomycetes colonized roots of tested seedlings. The rest of the mycorrhizal pool from forest nurseries was typically dominated by pioneer fungal ascomycetes. W. mikolae was the most common mycorrhizal ascomycete present at a high frequency on NSS from both age classes and with very high abundance (average 90%) on 1-year-old seedlings. Some other ascomycetes (Pezizales 1, Pezizales 2 and Pezizales 3) appeared on tested larches at a low frequency, but sometimes in high abundance. Tuber spp. appeared at a low frequency and low abundance. The relative abundance of S. grevillei was positively correlated with the age of seedlings, while W. mikolae was negatively correlated with age. Tuber sp. 1 and 2, Pezizales 2, and W. mikolae were positively associated with the basic soil pH values. However, forward selection of the environmental variables showed that only the age of the larch seedlings contributed significantly (F = 11.45, P = 0.02) to the variance in the ECF community. 相似文献
8.
参考genebank已发表的IBV纤突蛋白S2基因序列,设计了两对特异性引物,对鸡传染性支气管炎病毒黑龙江肾型分离株Mg/Mk和K进行RT-PCR扩增,将扩增后得到的PCR产物克隆入pMD18-T载体,并进行测序和分析。结果显示:S2基因的核苷酸全长为1884bp,编码一条由628个氨基酸组成的多肽,与网上报道的相一致。地方分离株Mg株、Mk株、K株分别和标准株T株比较,其同源性分别为92.3%、94.7%和94.2%。而Mg和Mk株的同源性为97.2%,Mg和K株的同源性为96.7%,Mk和K株的同源性为99.5%。说明地方分离株的亲缘关系较近,而和T株的亲缘关系较远。 相似文献
9.
10.
Kim Yrjälä Riikka Katainen Ulla Saarela Martin Romantschuk 《Soil biology & biochemistry》2004,36(1):199-201
The combined and separate effects of Cd and wood ash on Archaea from coniferous forest humus were studied in a microcosm experiment. Nonmetric multidimensional scaling of the denaturing gradient gel analysis of polymerase chain reaction amplified 0.9 kb 16S ribosomal DNA fragments revealed changes in archaeal communities due to the ash treatments. Cd with or without ash did not further influence the result. Representatives of the ash and control communities were cloned, grouped by restriction fragment length polymorphism analysis and finally sequenced. All sequences belonged to non-thermophilic Crenarchaea. 相似文献