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1.
大花君子兰叶绿体基因组及其特征 总被引:3,自引:0,他引:3
采用Illumina MiSeq测序平台对大花君子兰(Clivia miniata)叶片总DNA进行测序,通过组装获得了其叶绿体基因组(cpDNA)全长序列(158 114 bp)。对其cpDNA注释得到135个基因,包含87个蛋白编码基因、40个tRNA基因和8个rRNA基因。采用生物信息学方法对获得的cpDNA进行简单序列重复(SSR)分析和密码子偏好性分析。结果显示:①大花君子兰cpDNA中共有61个SSR位点,其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复数分别为38、9、2、8、3和1个,多数SSR分布在基因间隔区;②大花君子兰cpDNA密码子偏爱以A或U(T)结尾,亮氨酸使用频率最高,半胱氨酸使用频率最低。基于24种植物的cpDNA全长和23种植物的叶绿体ycf2基因序列进行系统发育分析,结果显示大花君子兰与石蒜科植物在同一分支,显示最近的亲缘关系,支持大花君子兰属于石蒜科。基于叶绿体ycf2的系统发育分析结果与基于cpDNA全长的系统发育分析研究结果大部分相同,支持ycf2基因可以代替cpDNA全长用于植物系统发育分析。 相似文献
2.
3.
鸡的微卫星DNA标记与胴体性状的相关分析 总被引:4,自引:1,他引:3
测定了青脚麻鸡与隐性白鸡杂交后自交的F2代个体的全净堂重、全净堂率、脂肪宽带、腹脂重和腹脂率6个胴体性状,检测10个微卫星DNA标记,对标记基因型胴体性状值进行方差分析和多重比较,结果表明:MCW328对于10周龄体重和全净膛重两性状各基因型均有显著的差异(P<0.05);ADL292对于腹脂重性状各基因型有极显著的差异(P<0.01),对于腹脂率有显著的差异(P<0.05)。MCW328标记基因与控制10周龄体重和全净膛重QTL连锁,ADL292标记基因与控制腹脂重和腹脂率QTL连锁。 相似文献
5.
微卫星DNA标记技术在畜禽遗传多样性研究中的应用 总被引:4,自引:0,他引:4
20世纪70年代人们已经知道,微卫星位点是广泛分布于真核生物基因组中的一种特殊序列,但直到1982年Hamada等在研究中发现从酵母到脊椎动物中普遍存在着多拷贝的多聚(dT-dG)微卫星DNA,Tautz和Rentz证实了这一发现。尽管从发现到现在只有二三十年的时间,但由于微卫星具有种类多、多态性高、进化速度快以及呈孟德尔共显性遗传等优点,使其 相似文献
6.
7.
为了建立一种对近交系大鼠遗传物质进行精确可靠、快速简便的监测方法,利用DNA指纹技术对国内6个品系8个近交系大鼠群体进行了DNA多态性的分析,并与PCR扩增微卫星DNA技术进行了比较.其结果显示(1)不同品系之间DNA指纹图差异较大,同一群体不同个体间DNA指纹图带的相似系数和共有带率除SHR(哈)和WKY(哈)小于0.7外,其他均大于0.9.不同地区同一SHR间和WKY间DNA指纹图也存在差异,相同DNA不同次制作的DNA指纹图谱基本一致.(2)不同品系个体间微卫星DNA具有显著多态性;同一群体不同个体之间除SHR(哈)的SMST位点和WKY(哈)的AGT位点出现一定的差异外,其他均没有差异.DNA指纹图能更精确可靠地反映出动物个体间的遗传背景,而微卫星DNA遗传监测方法比较简便快捷. 相似文献
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9.
为了建立一种对近交系大鼠遗传物质进行精确可靠、快速简便的监测方法,利用DNA指纹技术对国内6个品系8个近交系大鼠群体进行了DNA多态性的分析,并与PCR扩增微卫星DNA技术进行了比较。其结束显示:(1)不同品系之间DNA指纹图差异较大,同一群体不同个体间DNA指纹图带的相似系数和共有带率除SHR(哈)和WKY(哈)小于0.7外,其他均大于0.9。不同地区同一SHR间和WKY间DNA指纹图也存在差异,相同DNA不同次制作的DNA指纹图谱基本一致。(2)不同品系个体间微卫星DNA具有显著多态性;同一群体不同个体之间除SHR(哈)的SMST位点和WKY(哈)的AGT位点出现一定的差异外,其他均没有差异。DNA指纹图能更精确可靠地反映出动物个体间的遗传背景,而微卫星DNA遗传监测方法比较简便快捷。 相似文献
10.
经沼液浸种的早稻秧苗比对照组秧苗,具有较强的耐冷性,通过电镜对叶肉细胞超微结构动态观察证实,在低温(5°/5℃)下,叶绿体结构和细胞核结构,随着冷害天数的延长,伤害在不断加重,叶绿体结构会出现空洞,基质片断裂,直至崩溃。细胞核染色体凝集,核膜破裂,核内容物丧失等现象出现。而经沼液浸种的秧苗伤害程度有较明显的减轻。 相似文献