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【目的】开发多态性丰富的的InDel分子标记,为菜心育种提供研究基础。【方法】以Chiifu-401-42的基因组序列为模板,利用4份菜心材料的RAD-seq重测序数据,在全基因组范围内鉴定InDel位点。利用生物信息学方法筛选4份菜心材料间具有潜在多态性的InDel位点,挑选分布于10条染色体的80个InDel位点设计引物,对55份菜心种质材料进行遗传多样评价。【结果】通过与参考基因组序列比对,在4份菜心材料的重测序数据中共鉴定出84 510个InDel位点,其中插入/缺失长度大于5 bp的3 609个InDel位点在4份菜心材料间具有潜在多态性。挑选80个InDel位点进行PCR扩增验证,58个(72.5%)在4份测序样品中具有多态性,在55份菜心种质材料中检测到133个等位位点,多态性信息含量(PIC)为0.263~0.618,平均值为0.443。基于InDel标记的检测结果可知,55份菜心种质的遗传相似系数在0.366~0.756,平均值为0.570;在遗传相似系数为0.564时55份菜心种质被分为4个类群,但各类群间的耐热性没有明显差异。【结论】本研究开发的InDel标记具有... 相似文献
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建立菜心种质材料的分子身份证有利于菜心种质材料的收集、保存、管理和利用.利用荧光MFLP标记技术分析供试的36份菜心种质材料,从200对选择性扩增引物组合中筛选出扩增产物清晰稳定的18对引物组合.这些引物组合在36份菜心种质材料中有3~31等位变异,多态性信息量(PIC)和标记指数值(MI)分别在0.26~0.98和0.8~30.4之间.主坐标分析表明,18对引物组合可以区分各供试材料,并按遗传相似性将供试材料归为3个类群.考虑到使用最少引物组合区分不同种质材料,筛选和确定出PIC和MI值最高的3个MFLP选择性扩增引物组合(tfCCTA(CA)7/mAAG、tfGGTC(ATT)5/mCAA和tfCCTA(CA)7/mCTC)作为核心引物组合,建立3个引物组合检测到每份种质材料等位变异有(1)无(0)的二进制数据,并将其转换成简捷直观的16进制数据,从而构建了供试菜心种质材料的分子身份证. 相似文献
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广研1号青瓜是广州市农业科学研究所选育的华北生态型黄瓜杂种一代.具有早熟、商品性状优、抗性较强等优点,适合南方地区春秋露地栽培.
特征特性
植株生长势强,叶片深绿色,以主蔓结瓜为主,第一雌花节位为第5节,瓜长棒形,长约35 cm,横径4.5 cm左右,瓜条顺直,平均单果重约350 g,果皮深绿色,有光泽,白刺,刺瘤少、小,瓜把短,果脐部黄色条纹短而不明显,肉质脆、清香、甜、无苦涩味.商品性状好,品质优.播种至采收45~55天,全生育期80~100天,田间表现抗病毒病、霜霉病、白粉病和枯萎病,较抗疫病. 相似文献
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