简化基因组测序在畜禽应用中的研究进展

简化基因组测序(reduced-representation genome sequencing, RRGS)是指利用生物信息学方法设计标记开发方案,富集特异性长度片段,应用高通量测序技术获得海量标签序列来代表目标物种全基因组信息的测序方法。通过RRGS能够发现更多新的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,为研究控制畜禽生长发育、肉质调控、代谢调节基因及其遗传进化多样性提供重要基础分析数据。文章主要对RRGS中的限制性酶切位点相关DNA测序(restriction-site associated DNA,RAD-seq)、2b-RAD(ⅡB restriction-site associated DNA)、双酶切简化基因组测序(double digest RAD,ddRAD-seq)和基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)四种技术原理及在畜禽分子标记开发、遗传图谱构建和数量性状定位(QTL)方面的应用进行综述,旨在为简化基因组测序在畜禽育种研究中的应用提供基础资料。     

静原鸡胸肌和腿肌肌苷酸特异性沉积相关circRNA的联合分析

旨为分析静原鸡胸肌和腿肌中circRNA的表达模式与肌苷酸(Inosine monphosphate,IMP)在肌肉组织特异性沉积的关系。利用RNA-seq技术对选取的具有相同遗传背景180日龄静原鸡胸肌和腿肌进行全转录组测序,对获得的测序数据进行拼接、比对、注释和差异分析等,并对差异表达的circRNA和mRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,使用qRT-PCR对转录组结果进行表达量验证。结果表明:共筛选到circRNA 3 283个,组织特异性表达circRNA 242个。以|log2Fold change|≥1,P0.05为筛选条件,共得到差异circRNA 446个,DEGs 1 100个,差异miRNA 36个;对差异表达的circRNA和mRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,两者都显著富集于糖酵解/糖异生通路和心肌细胞的肾上腺素信号传导,并且差异circRNA显著富集于嘌呤代谢通路,DEGs显著富集于氨基酸的生物合成、磷酸戊糖途径、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢等与IMP合成高度相关的通路。对差异circRNA进行靶基因预测,构建circRNA-miRNA-mRNA可视化共表达网络,筛选到以novel＿circ＿0013580、novel＿circ＿0012931、novel＿circ＿0011886、novel＿circ＿0013588、novel＿circ＿0007737和novel＿circ＿0008274为核心的转录后调控因子和以PKM2、GART为核心的靶基因,靶向基因分析发现IMP合成关键调控因子可能来源于同一亲本基因的novel＿circ＿0013580和novel＿circ＿0013588,两者能够同时结合novel＿409作用于靶基因GART。对6个circRNA和6个miRNA qRT-PCR检测结果与全转录组测序结果趋势一致。综上,circRNA在静原鸡胸肌和腿肌中的差异性表达与IMP的特异性沉积具有相关性,为研究地方鸡种IMP在肌肉组织中特异性沉积的分子机制提供参考信息。     

牛奶中矿物质元素含量测定的研究

研究通过对牛奶中矿物质元素含量的测定,为人们对牛奶营养成分的了解,提供一定的理论数据。采用干法消化-火焰原子吸收法分别对牛奶中的钾、钠、镁、钙、铁、锰、铜、锌等矿物质元素含量进行了测定,共采集到奶样90个。结果显示,日均产奶量不同奶牛的牛奶中,各种矿物质元素含量没有显著差异(P>0.05),并且钾、钠、钙、镁、锌、铁、铜、锰的含量依次降低,表明牛奶中的矿物质元素含量丰富。     

必需氨基酸营养对奶牛乳腺蛋白合成调控的研究进展

在乳制品的开发过程中,乳蛋白是评估牛乳营养价值的重要指标。饲料配方优化是当下实现奶牛生产提质增效的重点工作之一。目前,饲喂过瘤胃氨基酸虽是提高奶牛乳蛋白合成最直接且高效的途径,但多数研究仅限于单一的限制性氨基酸,忽略了对氨基酸营养平衡体系的认识。在奶牛机体内,氨基酸营养作为乳蛋白合成的底物与信号物质,影响着乳腺对血液氨基酸的吸收与利用,但其分子代谢机制尚不明晰。本研究主要从氨基酸对奶牛乳腺蛋白合成的影响及调控两方面进行分析,首先概述了乳蛋白合成的基本途径,必需氨基酸、非必需氨基酸、组合必需氨基酸对乳蛋白产量及浓度的影响;其次详细介绍了必需氨基酸与组合必需氨基酸的供给对奶牛采食量、血液氨基酸浓度、血流量、乳腺细胞的影响,同时在细胞分子角度讨论了乳腺细胞培养所需氨基酸的最优添加剂量,以及必需氨基酸对氨基酸转运载体和信号通路的特异性调节。综上,通过对奶牛乳腺蛋白合成影响因素和分子调控机制的探讨,有助于优化饲料中理想的氨基酸配比与科学的生产模式,为氨基酸营养提高乳蛋白合成的相关研究提供理论参考。     

饲料油菜对发酵全混合日粮品质的影响

为研究饲料油菜对发酵全混合日粮(FTMR)品质的影响,试验以高含水量的油菜作为全混合日粮中的水分调节因子,调制水分含量为40％、45％、50％、55％和60％的5种全混合日粮,将其装入发酵瓶压实密封制备FTMR,在发酵第3、7、15、23、30、45、60天取样测定pH,并在第60天进行感官评定、测定主要营养物质和发酵...     

宁夏地区规模化养殖场奶牛营养与乳成分研究

为了解宁夏地区规模化养殖场奶牛营养及牛奶品质状况,我们于2011年9月、10月、11月对某典型养殖场奶牛日粮营养水平及乳成分进行了调查研究,共采集到高产组(日均产奶量大于等于30 kg)奶样37个,中产组(日均产奶量在20~30 kg)39个,低产组(日均产奶量小于20 kg)17个。结果显示,中产组牛奶的乳脂率极显著高于其他两组(P<0.01),低产组牛奶的乳糖显著高于高产组(P<0.05),然而,3个处理组之间乳蛋白含量并没有显著性差异(P>0.05)。研究表明,日粮中粗纤维含量对乳脂肪影响最大,随着日粮精料比的增加,乳脂率在降低;提高日粮粗蛋白水平对提高乳蛋白含量的影响不明显,而对乳蛋白产量有一定的正效果。     

犬细小病毒病的病理学观察

文章对一例吉娃娃幼犬细小病毒病肠炎综合征病例进行了病理学诊断和检查,发现肠道广泛坏死,有充血出血现象,心脏心肌柔软,凝血不良,心房扩张,且伴有慢性出血性肺炎.光镜下见肠绒毛上皮细胞广泛变性、坏死、脱落,肠腔中有大量脱落的绒毛上皮细胞和炎性渗出物,固有层有多少不等的炎性细胞浸润,肠腺和肠绒毛上皮均可见特征性的核内包涵体;心肌纤维也有程度不等的变性、坏死,炎症细胞浸润.     

添加纤维素酶和布氏乳杆菌对葡萄渣全混合日粮发酵品质及有氧稳定性的影响

为研究纤维素酶和布氏乳杆菌对葡萄渣全混合日粮发酵品质及有氧稳定性的影响,试验设置无添加（对照组）、添加50 mg/kg纤维素酶（Ⅰ组）、100 mg/kg纤维素酶（Ⅱ组）、10 mg/kg布氏乳杆菌（Ⅲ组）、30 mg/kg布氏乳杆菌（Ⅳ组）、50 mg/kg×10 mg/kg纤维素酶和布氏乳杆菌混合（Ⅴ组）、100 mg/kg×30 mg/kg纤维素酶和布氏乳杆菌混合（Ⅵ组）。密封进行发酵,在45 d采样测定其感官品质、营养成分、发酵品质,同时将剩余的发酵全混合日粮暴露到空气中,插入温度记录仪探头记录温度变化,评定青贮饲料的有氧稳定性。结果表明：与对照组相比,添加纤维素酶和布氏乳杆菌均能改善发酵全混合日粮（FTMR）的感官品质|Ⅱ组、Ⅳ组和Ⅴ组的粗蛋白质含量显著高于对照组（P ＜ 0.05）,分别提高了4.6%、6.6%、2.9%|Ⅱ组的中性洗涤纤维含量显著低于对照组（P ＜ 0.05）,降低了4.92%|添加纤维素酶和布氏乳杆菌对FTMR的pH影响显著（P ＜ 0.05）,添加布氏乳杆菌组、纤维素酶×布氏乳杆菌组的FTMR pH均降低,其中Ⅴ组的pH最低,为4.33|添加剂组的乳酸含量显著高于对照组（P ＜ 0.05）,分别提高了15.28%、20.07%、26.82%、22.56%、30.55%和29.31%,其中Ⅴ组最高,Ⅵ组次之|Ⅵ组丙酸含量显著低于对照组（P ＜ 0.05）,降低了26.92%|添加纤维素酶和布氏乳杆菌可显著影响FTMR有氧稳定性（P ＜ 0.05）,其中Ⅲ组、Ⅳ组和Ⅴ组有氧稳定时间分别提高了93.09%、122.07%、70.15%,且均在112 h以上。综上所述,添加纤维素酶和布氏乳杆菌均能改善葡萄渣发酵全混合日粮发酵品质、感官品质和营养成分,能提高其有氧稳定性。 [关键词] 发酵全混合日粮|纤维素酶|布氏乳杆菌|发酵品质|有氧稳定性     

pH值和含甘油稀释液平衡时间对藏獒精液冷冻保存活率的影响

试验筛选6条种公藏獒在其繁殖季节9—12月份以不同pH梯度(5.5、6.0、6.5、7.0、7.5)稀释液和不同甘油平衡时间(10、20、30、40、50、60、70、80min和90min)对藏獒精液进行冷冻,检查冷冻前后活率变化。结果表明:藏獒精子在pH为6.5的稀释液中有较高冷冻前后活率;甘油平衡时间对藏獒精液活率有较大影响,以甘油平衡时间为20min所得藏獒冷冻精液的效果较好。     

生物饲料在动物生产中的应用

生物饲料是现代饲料发展的一个新的风向标,其可提高饲料的利用率,同时可利用农业废渣等拓展饲料资源,在畜禽生产中具有广阔的应用前景.本文综述了生物饲料的定义及主要种类,并阐述了其对动物生长性能、抗氧化性能、免疫能力、肠道菌群、产品品质和环境污染等的影响及生物饲料应用中存在的问题,以期为生物饲料的研究、生产及应用提供参考.