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应用基因芯片检测中国野生葡萄抗白粉病基因表达 总被引:1,自引:0,他引:1
张军科 桑春果 王跃进 张朝红 史江莉 粟霞 罗世杏 ZHANG Jun-ke SANG Chun-guo WANG Yue-jin ZHANG Chao-hong SHI Jiang-li SU Xia LUO Shi-xing 《园艺学报》2008,35(7):1053-1058
本文研究了利用Affymetrix的欧洲葡萄基因表达芯片检测中国野生葡萄基因表达的可行性,并检测了葡萄白粉菌(Uncinular necator)人工接种诱导后48 h后的基因表达情况。结果表明,该芯片可以在感病材料中检测出表达的基因11 906个,抗病材料中检测到表达的基因11 839个,在二者中同时检出表达的基因11 839个,能够检出的基因数占该芯片基因探针组总数的71.3%,因此用欧洲葡萄基因芯片检测中国野生葡萄中基因表达水平是完全可行的;并利用此芯片检测出在人工接种诱导后,抗病材料中和感病材料相比表达上调的基因共1 920个,占检测出基因总数的16.21%;表达下调的基因数1 760个,占检测出基因总数的14.87%;表达上调和下调的幅度(signal log ratio)都在1~7倍之间。 相似文献
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应用CDDP和SRAP分子标记技术对35个杧果品种进行遗传多样性分析,统计遗传多样性信息数据,并进行聚类分析和主成分分析。结果表明,12条CDDP引物和12对SRAP引物组合分别扩增得到条带263条和243条。其中多态性条带数分别为250条和230条,多态性条带比率分别为95.45%和94.61%,有效等位基因数分别为1.59和1.62,Nei’s基因多样性分别为0.32和0.24,Shannon信息指数分别为0.55和0.46,多态性信息含量分别为0.60和0.59,遗传相似系数变化范围分别为0.64~0.96和0.64~0.92,平均遗传相似系数分别为0.80和0.78,CDDP结合SRAP标记遗传相似系数变化范围为0.62~0.94,平均遗传相似系数为0.78。CDDP标记、SRAP标记以及CDDP结合SRAP标记分别在遗传相似系数为0.709 5、0.694 7以及0.685 0处可以将35个杧果品种分别分为3类、3类和5类,说明两种标记结合分析能够更加详细地解释杧果品种间的亲缘关系。而主成分分析结果和聚类分析结果有相似之处,但也有很大不同。 相似文献
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利用 SRAP 分子标记技术对来自 12 个国家或地区的 54 份杧果种质进行了遗传多样性分析,并对 SRAP 标记在杧果研究中的效率做了探讨。结果表明,SRAP 标记在杧果种质中具有丰富的多态性,引物多态性条带百分比在79.31%~100%,平均93.10%;引物的有效等位基因数(Ne)、Nei’s 基因多样性指数(H)、Shannon’s 信息指数(I)和多态性信息含量(PIC)平均值分别为 1.73、0.41、0.60 和 0.87,表明 SRAP 标记具有较高的多态性检测效率。基于SRAP 标记计算获得的遗传相似系数对杧果种质做聚类分析,54 份杧果种质可被划分为 3 个类群。主成分分析与聚类分析反映的种质亲缘关系基本一致。 相似文献