2020—2021年中国部分地区猪流行性腹泻病毒S1基因遗传变异分析

【目的】了解2020―2021年猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)的流行情况和遗传变异情况。【方法】本研究对中国部分地区73个猪场的525份样本进行RT-PCR检测,对检测为阳性的样本进行PEDV S1基因扩增与测序,并进行流行病学统计分析,使用DNAStar软件进行核苷酸相似性分析和氨基酸位点变异分析,利用Mega 6.06软件对PEDV S1基因进行遗传进化分析,对疑似重组的序列使用RDP4软件进行S1基因重组分析。【结果】在2020—2021年的525份临床样本中PEDV检出阳性率为26.29%(138/525)。流行病学统计分析显示,冬季属于PEDV高发季节,1日龄仔猪感染率最高,为42.75%(59/183),并在中国6个地区大范围流行。S1基因遗传进化分析显示,138株PEDV S1基因序列主要位于两个分支,131株毒株属于G2群,其中126株属于G2a亚群,与HBXY2、SNJ-P在同一亚群,5株属于G2b亚群,与AJ1102、LW/L、S14在同一亚群;其余7株毒株位于G1群和G2群之间,形成一个独立分支。经重...     

2021年我国猪繁殖与呼吸综合征病毒分子流行病学调查与遗传变异性分析

<正>猪繁殖与呼吸综合征（Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS）是由病毒（PRRSV）引起的猪的一种繁殖障碍和呼吸系统的传染病,其临床特征是母猪发热厌食,妊娠后期流产,产死胎和木乃伊胎;仔猪则发生呼吸系统疾病且大量死亡,由于部分病猪耳部发紫,俗称“蓝耳病”。PRRSV为有囊膜的RNA病毒,其基因组为单股正链,不分节段,     

全国部分地区H9亚型禽流感病毒分子流行病学和遗传变异分析

旨在了解2020—2021年间全国部分地区H9亚型禽流感病毒(H9-AIV)的分子流行病学和遗传变异情况，因此从全国部分地区采集到10 336份临床样本进行了H9-AIV包括核酸检测、病毒分离、HA基因测序和遗传变异等方面的分析。病原核酸检测结果显示，AIV-H9阳性率为16.1%(1 665/10 336),白羽肉鸡中的检出率最高，商品肉鸡检出率高于蛋鸡。本研究获得920株H9-AIV分离株，其中464个代表性毒株的遗传进化分析显示，所有分离株全部位于h9.2.4.5分支，且均为典型低致病性AIV,与WJ57毒株核苷酸和氨基酸同源性分别为92.2%～99.9%和89.6%～99.8%;结合关键氨基酸位点分析，这些分离株逐步向哺乳动物适应性和气溶胶传播方向发生变异。以上数据表明，H9-AIV分离株进一步增强了对哺乳动物的感染力且传播力不断加强，因此持续监控其检出和变异对家禽健康养殖、人类健康至关重要。