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SNP检测方法的研究进展 总被引:3,自引:0,他引:3
作为近年来最有发展潜力的第三代分子标记,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)在遗传分析中得到了广泛应用。目前SNP的检测方法大致可以分为两大类:一大类是以单链构象多态性(SSCP)、变性梯度凝胶电泳(DDGE)、酶切扩增多态性序列(CAPS)、等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)等为代表的以凝胶电泳为基础的传统经典的检测方法。另一大类是以直接测序、DNA芯片、变性高效液相色谱(DHPLC)、质谱检测技术、高分辨率溶解曲线(HRM)等为代表的高通量、自动化程度较高的检测方法。本文综述了两大类SNP检测方法中主要检测技术的原理和应用,并分析在实际应用中各种检测技术的优缺点。 相似文献
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根据水鸟的重点分布区域及调查的可行性,对黄河三角洲地区的重点监测区域,分专项调查和普通监测两种方式开展水鸟调查,采用直接计数法,统计水鸟的种类、数量。 相似文献
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通过对温室盆栽玉米进行传统施肥、普通硫基复合肥、新型硝硫基复合肥3种施肥处理,分析和探讨新型硝硫基复合肥对玉米生长情况及产量的影响。结果表明,施用50 kg/667 m~2新型硝硫基复合肥相对于等量的其他2种施肥方式,穗质量分别提高32.2%、10.1%;穗粒数分别提高17.9%、13.2%;穗粒鲜质量分别提高20.4%、15.7%;穗粒干质量分别提高19.6%、14.3%。因此,施用新型硝硫基复合肥(N-P_2O_5-K_2O:15-15-15)相对于传统施肥方法和施用普通硫基复合肥(N-P_2O_5-K_2O:15-15-15),可以明显提高玉米的穗质量、穗粒数和穗粒质量,对玉米有着显著的增产效果。 相似文献
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指出了黄河三角洲国家自然保护区内具有丰富的芦苇资源,从防止外界干扰破坏、创造芦苇适宜的生长环境、加强病虫害防治等方面探讨了芦苇的保护对发挥其生态作用、旅游价值和经济效益具有重要的作用。 相似文献
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单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)广泛存在于甘薯基因组中,可用于甘薯遗传图谱的构建、关联分析和分子标记辅助选择等重要研究。本研究采用两种特异性扩增的方法:等位基因特异性PCR(AS-PCR)和四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR),以及酶切扩增多态性序列(CAPS)酶切的方法,对甘薯徐781和徐薯18之间的2个SNP位点T2-32906(C/G)和T3-30695(G/A)进行检测,并通过比较3种检测方法的检测效果,找出快速高效的甘薯SNP分子标记检测方法。琼脂糖凝胶电泳结果显示:AS-PCR的检测结果在2个样本之间出现假阳性而没有明显的差异条带,Tetra-primer ARMS-PCR和CAPS两种方法的检测结果在2个样本间呈现出明显的差异条带,并且能够根据条带数目区分等位基因是否纯合。三种方法的检测结果表明:相对于其他两种检测方法,Tetra-primer ARMS-PCR呈现出更理想的检测效果。另外通过成本比较,Tetra-primer ARMS-PCR成本明显低于CAPS。因此,Tetra-primer ARMS-PCR是一种可用于甘薯SNP位点快速、高效且费用低廉的分子检测方法。 相似文献