胆囊收缩素A型受体基因序列变异和表达与略阳乌鸡饲料转化率的关联性研究

【背景】 食欲和饲料转化率的提高构成了现代肉鸡快速生长的生理基础。胆囊收缩素A型受体（CCKAR）是介导胆囊收缩素（CCK）饱食信号和消化调节作用的关键受体。鉴于CCK信号在能量平衡调节中的重要作用，CCKAR的表达水平与鸡的生长性能密切相关。然而，CCKAR水平调节鸡生长的确切机制尚不清楚。【目的】 通过研究阐明CCKAR基因表达水平和序列变异与鸡饲料转化率的关系，为鸡生长性状遗传调控研究和饲料转化率选育奠定基础。【方法】 测定略阳乌鸡12—16周龄料肉比（公鸡n=62，母鸡n=67）和26—30周龄料蛋比（n=150）。用PCR-RFLP法检测CCKAR基因内两个同义突变（g.73206714T>C和g.73209189C>T）的基因型。以性别为固定效应，用双因素方差分析检验g.73206714T>C和g.73209189C>T与料肉比的关联性，用单因素方差分析检验2个SNP与料蛋比的关联性。用JASPAR数据库预测g.73206714T>C对转录因子结合位点产生的影响。以g.73206714T>C为标记，选取10只杂合子（CT）公鸡，用PCR-RFLP法检测CCKAR基因在g.73206714T>C位点等位基因间的表达差异。选取30只带有采食量和料肉比记录的公鸡，用qPCR检测CCKAR基因在下丘脑、脑垂体、胰腺、胆囊和十二指肠中的表达水平，分析CCKAR表达水平与采食量和料肉比的相关性。【结果】 性别效应对略阳乌鸡料肉比有显著影响（F=29.44，P<0.0001），公鸡的料肉比（5.41±0.76）显著低于母鸡（6.62±1.00）。在两个同义突变中，只有g.73206714T>C与料肉比显著关联（F=8.44，P=0.0004），其中，TT型的料肉比（5.18±0.63）显著低于CC（6.37±1.1）和CT型（6.17±0.95）。CC型和CT型的料肉比无显著差异。g.73206714T>C与性别的互作效应对料肉比的影响不显著。G.73206714T>C对28个转录因子结合位点有潜在影响。等位基因特异性表达试验显示，T等位基因的转录本丰度显著高于C等位基因，表明CCKAR在等位基因间的表达差异很可能是构成g.73206714T>C与料肉比关联性的遗传基础。略阳乌鸡26—30周龄的平均料蛋比为2.85±0.41。g.73206714T>C和g.73209189C>T的基因型效应对料蛋比的影响均不显著。在5个组织中，CCKAR基因在胰腺中的表达水平最高，且与采食量呈负相关（r=-0.45, P=0.017）。但是，在其他组织中，CCKAR的表达水平与采食量的关联性均不显著。对于料肉比性状，CCKAR基因在胰腺（r=-0.41，P=0.03）和脑垂体（r=-0.57, P=0.0018）中的表达水平越高，料肉比越低。在其他组织中，这种负相关性均不显著。【结论】 研究发现CCKAR基因表达水平上调有利于提高鸡的饲料转化率。G.73206714T>C的T等位基因是一个与CCKAR基因高表达活性和高饲料转化率显著关联的分子标记。     

略阳乌鸡开产日龄遗传参数估计和FSHR基因序列变异与开产日龄的关联性分析

为从遗传参数估计和FSHR基因序列变异关联分析角度定量评估遗传效应对略阳乌鸡开产日龄的决定性，以同一批次孵化的675只略阳乌鸡母鸡为对象，测定开产日龄、开产到30周龄、40周龄和56周龄产蛋数，用单变量动物模型估计开产日龄的遗传力，用双变量动物模型估计开产日龄与产蛋数间遗传相关。用Sequenom MassARRAY法检测FSHR基因内3个错义突变Thr46Ile、Lys151Arg和Met335Thr的基因型，用单变量线性混合模型检测这些变异与开产日龄的关联性。结果表明:1)略阳乌鸡的平均开产日龄为(147.5±7.8)d，其中，75%的鸡会在151日龄前开产。30周龄平均产蛋数为(28.0±7.6)枚，40周龄平均产蛋数为(58.6±15.0)枚，56周龄平均产蛋数为(75.1±20.4)枚。2)略阳乌鸡开产日龄的遗传力为0.08(95 %置信区间:0.017~0.21)。开产日龄与各阶段产蛋数存在强负遗传相关性(r_A=-0.98，95 %置信区间:-1.0~-0.7)，但呈现出中等偏弱的表型相关性(r_p=-0.59~-0.21)。各阶段产蛋数间存在较强的遗传(r_A=0.99，95 %置信区间:0.84~1.00)和表型相关(r_p=0.48~0.79)。3)在3个FSHR错义突变中，第46位Thr和第335位Met不保守，但第151位Lys在鸟类和哺乳动物中完全保守。3个错义突变与略阳乌鸡开产日龄的关联性均不显著(P>0.05)。综上，遗传效应对开产日龄的决定性较低，但开产日龄与产蛋数存在较强遗传相关性。这些结果建议，饲养管理是开产日龄更为有效的调控手段；依据开产日龄对产蛋数进行间接选择具有可行性，但选择准确性会随产蛋周期的延长而降低。