猴樟CbMYB308转录因子基因克隆及生物信息学分析

为研究猴樟CbMYB308蛋白的序列结构和功能，该文克隆猴樟CbMYB308基因CDS序列，进行生物信息学分析。结果表明，克隆得到的序列具有1个942 bp完整的ORF框，编码313个氨基酸，与沉水樟中收录的RWR91885.1基因序列一致性达97.29%，系统进化树的结果表明，猴樟CbMYB308蛋白具有较高的保守性；猴樟CbMYB308蛋白生物信息学分析结果表明，CbMYB308蛋白具有PLN03091家族结构域，为R2R3-MYB型转录因子，CbMYB308蛋白化学分子式为C₁₄₉₆H₂₃₅₆N₄₃₂O₄₈₉S₁₁，相对分子量34.57 kDa，理论等电点6.12，结构不稳定，无序化特征明显，为脂溶性和亲水性蛋白，磷酸化氨基酸位点有53个，亚细胞定位预测为细胞核。