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逐个SNP的全基因组关联分析中的统计量不仅依赖于遗传效应,而且依赖于SNP,因此统计量不能直接应用于推断无遗传效应的零假设中。检测不同样本的QTN,常用的统计量除了卡方统计量,还有t统计量、F统计量和标准正态统计量。首先给出了各个统计量之间的关系,接下来针对冗余参数背景下的全基因组关联分析,提出了检验统计量阈值的快速计算方法。再次利用获得的高通量SNP的统计概率构建卡方统计量,进而估计临界值。最后模拟不同样本的阈值并与文献上提出的阈值算法比较。大量模拟实验证明,提出的方法快速而且有效。 相似文献
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对中国古代选举制度发展的动态过程进行考察梳理,探究其运动变化的基本趋向和总体特征(包括若干重要特征和最根本特征),认为从"任人唯亲"理念向"选贤与能"理念的重心转换是古代选举制度发展的最根本的特征,并指出古代选举制度对于今天的公务员选拔制度具有重要的借鉴意义。 相似文献
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为构建木材热处理窑内部循环风速和温度合理分布,提出一种操作性强易于实现的木材热处理窑三维模型建立方法。采用前处理软件(ICEM CFD)对实验型木材热处理窑做结构简化,并进行参数化建模,将模型进行网格划分。利用Fluent软件对木材热处理窑内的蒸汽流动情况进行分析,得出风速分布云图。研究木材热处理窑内热质耦合状态,得出其内部温度和湿度的具体状况,为优化木材热处理工艺参数,改进窑体设计提供理论依据。 相似文献
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目标区域捕获测序(TRS)是将基因组特定区域制成探针与基因组DNA杂交,将目标区域的DNA富集后再进行二代测序。TRS已应用于多种疾病如智力障碍、帕金森症等,能够有效的对人类主要组织相容性复合体(MHC)、外显子等区域进行测序。由于测序效果受捕获测序探针密度影响较大,探针的疏密及均匀程度很大程度会影响最终结果,与全基因组测序相比,TRS检测拷贝数变异(CNV)难度更大。随着生命科学的飞速发展,越来越多的拷贝数变异检测工具出现,但它们的CNV检测率依然较低,假阳性率较高。因此,本研究开发了一种新颖的拷贝数变异检测方法,结果显示,本研究方法、ExomeDepth和XHMM的检测率分别是76.7%、12.4%和5.5%,假阳性率分别是25.7%、49.4%和66.9%,本研究方法在检测率及假阳性率的表现均优于ExomeDepth和XHMM两种方法。本研究补充了拷贝数变异检测算法,并为相关研究提供一定的理论依据。 相似文献
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在生存分析中,Cox比例风险模型和加速失效模型是研究控制数量性状位点(QTL)的生存时间的常用的方法。本文首先借助于Cox比例风险模型给出了半参数的区间定位方法去表征生存性状的印记数量性状位点(iQTL)。此方法的明显优势是无需估计复杂的"讨厌"的基线风险函数。然后构造偏似然函数并根据其推断出iQTL的参数估计。采用期望最大化算法求解iQTL位置和遗传效应的极大似然估计值。所给统计推断方法保证了整个基因组范围内的显著iQTL的估计和检验,在一系列的零假设下,给出了所检测到的iQTL的印记模式。最后,此方法应用于分析一个公开发表的小鼠模型系统数据集。 相似文献
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本研究旨在对比值性状QTL采用贝叶斯定位方法进行探讨。将两个具有正态分布的普通数量性状之比定义为比值性状。由于此类性状不服从正态分布,因此在遗传分析上不同于普通性状。利用构成比值性状的两个组分性状的线性结合,我们提出了定位比值性状数量性状位点(QTL)的最大似然法。在此基础上,进一步探索比值性状的贝叶斯定位策略。首先采用贝叶斯压缩方法估计两个组分性状的QTL参数,然后利用两个组分性状的群体均值和QTL遗传效应,产生一个关于比值性状QTL遗传效应的后验样本,通过对这个后验样本的统计分析,来推断比值性状的QTL。模拟研究表明:新方法表现出比似然法更高的QTL检测效力。 相似文献
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面对动物试验指标的综合性特征,过去人们习惯按每个试验指标分别独立地采用一元协方差分析法比较不同水平或处理效果间的差异,其结果一方面由于每个指标在不同水平或处理的表现可能不完全一致而很难下一个综合的结论;另一方面因为没有考虑各指标间可能存在的相关而最终得不到正确的统计结论。鉴于此,此次根据试验目的,结合多元方差分析、T检验与一元协方差分析方法系统地探讨了动物试验多指标差异的统计比较问题。 相似文献
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