镍小团簇中金属键的E L F和L O L函数研究

用非限制性密度泛函方法UBP86泛函结合def2-TZVP基组获得了Ni2～6团簇的几何结构并用ELF(ElectronLocalized Function)和LOL(Localized Orbital Locator)函数对小镍团簇的电子结构进行拓扑分析.研究结果表明,除Ni2团簇外,团簇中Ni—Ni键的成键临界点不在键轴上,为弯曲键.镍团簇中Ni—Ni间的金属键为部分共价键,其价层Basin的布局数均小于1e,并且团簇中存在多个多中心价层Basin.团簇中各个化学键均强烈离域化.团簇中的单电子主要位于内层轨道,并没有参与成键.     

续随子醇L713,283二萜类化合物溶液构象的分子模拟

将续随子醇L713,283二萜类化合物放入甲醇和氯仿两种不同极性的溶液中,分别进行长时间的分子动力学模拟.结果表明,续随子醇L713,283二萜类化合物在氯仿溶液中更稳定,构象波动幅度更小;续随子醇L713,283二萜类化合物五元环和十一元环侧链上的O71及O15与甲醇羟基所形成的较稳定氢键是其易溶于含氧有机溶剂的重要驱动力.基于续随子醇L713,283二萜类化合物在氯仿溶液中的3个代表性构象,用密度泛函理论优化获得它们的稳定构象、静电势电荷及键参数.模拟结果与试验吻合较好,为基于配体结构的药物分子设计提供了理论基础.     

甲基苯并唑衍生物与HIV-1逆转录酶相互作用的分子模拟研究

对HIV-1逆转录酶(RT)与二氟甲基苯并唑甲基嘧啶硫醚(DFMMT)及甲基苯并唑甲基嘧啶硫醚(MMT)两个甲基苯并唑衍生物的复合物进行了分子动力学模拟,从分子整体、结合模式优化和水分子作用3个角度详细分析了甲基苯并唑衍生物与HIV-1 RT相互识别的机制.结果表明,DFMMT和MMT在RT中的结合位点几乎一致;但DFMMT与RT的π-π堆积作用更强.另外,RT的DFMMT结合口袋中有3个稳定的水分子存在,而MMT结合则没有水分子参与.3个水分子的协同使得DFMMT与RT的相互作用强于MMT,这可能是双氟促进抑制活性的作用机制之一.     

生物技术专业有机化学教学改革研究

有机化学是本科生物技术专业的一门重要的专业基础课程。该文针对目前高校专业基础课课时压缩的情况,结合教学实践和体会,指出现有教学中的弊端,提出了改革探索与实践方案。