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甘薯基因组NBS-LRR类抗病家族基因挖掘与分析 总被引:1,自引:0,他引:1
NBS-LRR类基因家族是植物抗病R基因(Resistance gene)数量最多的一类,具有NBS (Nucleotide-binding site)和LRR (Leucine-leucine-repeat)结构域。甘薯(Ipomoea batatas)栽培种基因组已完成测序,但尚未注释,本研究对甘薯基因组序列进行外显子预测,得到甘薯染色体组全基因组蛋白序列,在此基础上进一步对NBS-LRR家族基因鉴定和分析表明,甘薯基因组中含有379个NBS-LRR家族基因,占全基因组基因总数的0.212%,其中N型亚家族120个,NL型103个, CNL型133个, TNL型22个, PN型1个。所有染色体上均有NBS-LRR家族基因分布,但数量明显不同,其中有60.9%的NBS-LRR基因序列呈簇状分布。NBS-LRR基因序列有15个保守结构域,在N端较为保守。研究结果为甘薯进一步开展NBS-LRR家族基因的功能研究和抗性育种提供了参考。 相似文献
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运用农业气候相似原理和方法,分析汉中茶区与国内名茶产区的气候相似性,为汉中调整种植结构、引种发展茶产业提出科学依据。结果表明:汉中茶区气候资源优越,适宜优质茶叶生长,与国内名茶区信阳毛尖、都匀毛尖、六安瓜片、西湖龙井茶区气候相似度最高达1级可直接引种,与黄山毛峰茶区相似度较高为2级,适宜引种。充分利用气候资源,适当扩建或改良茶园,可引种信阳、都匀、六安茶区优质茶品种发展壮大汉中茶产业,并要积极适应气候变化,应对气候变暖背景下农业气象灾害,提高茶叶品质和经济效益。 相似文献
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