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为了丰富紫花槭转录组数据,进一步开展紫花槭秋季叶片呈色机制研究.本研究以紫花槭秋季转色期三个阶段(前期,中期,后期)叶片为材料,采用高通量测序技术进行转录组初步分析.转录组数据共获得50501条Unigene,有35316条Unigene在数据库中得到注释,其中NR数据库中注释到的Unigene数量最多,共35024条,占69.4%.在注释到的物种中,紫花槭比对的Unigene与甜橙(Citrus sinensis)相似度最高,共有4290条,占12.25%.紫花槭转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物学过程、细胞组分和分子功能3大类,共有25375条,其中生物学过程的基因最多,主要聚集于代谢过程和细胞过程等.基于Unigene库的基因结构分析,其中SSR分析共获得12711个SSR标记,占Unigene总数的36%.SSR位点共包含150种重复基元,单碱基重复所占比例最高(7184个,61.86%),四碱基重复、五碱基重复和六碱基重复所占比例较低.Unigene库中共有328239个SNP位点,发生频率为1/190 bp,SNP位点分为转换和颠换两种类型的碱基替换方式,其中碱基转换位点213787个(65.13%),碱基颠换位点114452个(34.87%),碱基转换类型发生频率高于颠换类型.6种单碱基变异中,2种转换类型A/G、C/T的发生频率分别为33.03%和32.10%;4种颠换类型中A/T发生频率最高,为11.52%;C/G发生频率最低,为5.79%.紫花槭转录组秋季叶色表达的转录组分析,可为紫花槭叶色基因调控、定向分子育种和培育彩叶新品种提供研究提供基础的数据信息. 相似文献
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本刊讯:天津市塘沽区乡镇畜牧兽医站下设5个基层工作站 ,1个宠物医院 ,肩负着全区34个自然村畜禽的防疫、治疗、技术咨询和兽药经营活动。由于塘沽区条件不同 ,畜牧业规模较小 ,年饲养生猪10万余头 ,肉牛、奶牛2000多只 ,羊1.7万多只 ,鸡、鸭等各种禽类50余万只。此前兽药采购来自多种渠道 ,价格有所差异 ,有些药品质量也得不到保证 ,群众反应较大。今年6月天津市畜牧局召开了全市畜牧业技物结合连锁经营研讨会 ,讨论中国牧业通讯杂志社组织加盟国牧直通连锁经营活动。我们认为这项工作很有前途 ,是我站今后抓住机遇、主动占领本区市场、增… 相似文献
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