对虾WSSV和IHHNV多重PCR检测试剂盒的研究与应用

在对虾白斑综合征病毒(WSSV)和传染性皮下和造血器官坏死病毒(IHHNV)二温式PCR检测技术前期研究的基础上,将这2种病原的特异性引物与PCR基础反应液一起组装成快速检测试剂盒。通过对试剂盒敏感性、稳定性和保存期等技术指标的测定以及对临床样品的检测试验,该试剂盒对同一样品中的WSSV和IHHNV DNA模板均能特异性地扩增出2条与实验设计相符的593 bp(WSSV)和356 bp(IHHNV)的DNA片段,而对其它对虾病原的扩增结果均为阴性;该试剂盒最低能检测到102pg的WSSV DNA和10 pg的IHHNV DNA。对WSSV和IHHNV DNA的检出量分别为102~103pg和10~102pg。     

副鸡嗜血杆菌16 S rDNA PCR检测方法的建立

根据副鸡嗜血杆菌的16 S rDNA基因序列设计一对特异性引物XZIC1和XZIC2,对6株副鸡嗜血杆菌进行PCR扩增。结果显示,该对引物对6株副鸡嗜血杆菌均扩增出与预期大小相一致的282bp片段,而对鸡毒支原体、禽巴氏杆菌、鸡传染性支气管炎病毒、鸡新城疫病毒、大肠埃希菌、鸡白痢沙门菌、禽流感病毒(H9)、鸡喉气管炎病毒及葡萄球菌等9种病原体的扩增结果均为阴性。该PCR敏感性结果表明,本方法可以检测到10pg的副鸡嗜血杆菌DNA模板。采用引物XZIC1和XZIC2,对分别用副鸡嗜血杆菌ctcc253、ctcc255、ctcc257、ctcc269株感染SPF鸡的临床病料DNA进行PCR扩增,均可扩增出单一的282bp的片段。     

裙带菜配子体与孢子体的附生微生物群落组成分析

裙带菜(Undaria pinnatifida)是一种重要的大型褐藻,具有较高的经济和食用价值。藻类的附生微生物既能通过代谢产物调控宿主藻类的生长发育,特定条件下又可能导致病害。了解裙带菜附生微生物群落组成对研究裙带菜与附生微生物间的相互作用、种质资源的有效保存以及防治藻类病害等有重要意义。现有研究大多集中于海带和紫菜,关于裙带菜的附生微生物,特别是不同生活史的对比研究还很少。本研究通过16S rRNA基因高通量测序发现,裙带菜配子体和孢子体的附生细菌群落组成有明显差异,配子体样品中的细菌群落丰度和多样性均大于孢子体。配子体中变形菌门(Proteobacteria)(66.67%)为第一优势菌门,其次为拟杆菌门(Bacteroidetes)(13.48%)和蓝细菌门(Cyanobacteria)(11.13%),α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)(34.58%)为第一优势菌纲,其次为γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)(31.01%);而孢子体中蓝细菌门(95.67%)占绝对优势,其次为放线菌门(Actinobacteria)(1.65%)和厚壁菌门(Firmicutes)(1.48%)。裙带菜样品经18S rRNA基因测序检测出链形植物(Streptophyta)、纤毛虫门(Intramacronucleata)、担子菌门(Basidiomycota)、顶复亚门(Apicomplexa)、节肢动物门(Arthropoda)、硅藻门(Bacillariophyta)、脊索动物门(Chordata)、腹毛动物门(Gastrotricha)、子囊菌门(Ascomycota)和毛霉菌门(Mucoromycota),其中,担子菌门、子囊菌门和毛霉菌门属于真菌,孢子体的真核微生物群落丰度大于配子体。本研究确定了裙带菜配子体和孢子体附生微生物群落组成以及不同细菌和真核微生物的相对丰度,结果表明,2个世代之间存在显著差异,为后续研究藻类宿主与微生物之间的相互作用、提高海带目褐藻种质保存技术提供了基础的数据支持。     

Expression profiles and functional prediction of ionotropic receptors in Asian corn borer,Ostrinia furnacalis (Lepidoptera: Crambidae)

Genes involved in chemosensation are essential for odorant-mediated insect behaviors. Odorant receptors(ORs) bind and respond to pheromones and plant volatiles, regulating insect behaviors such as mating and host-plant selection, while ionotropic receptors(IRs), which are present at lower levels in insects than ORs, influence ion channels, especially in agricultural pests. Asian corn borer, Ostrinia furnacalis, is the main pest of maize that causes huge economic losses in Asia. Twenty-one Ofur I...     

Role and regulation of calcineurin in angiotensin Ⅱ-stimulated cardiac myocyte hypertrophy of rats

AIM: To study the role and regulation of calcineurin(CaN) in angiotensin II(AngⅡ)-stimulated cardiacmyocyte hypertrophy of rats. METHODS: Using AngⅡ to induce the cultured cardiac myocyte hypertrophy of rats, and investigating the effect of CaN inhibitor on [³H]-leucine incorporation of AngⅡ-stimulated cardiomyocytes and the regulation of various factors on CaN activity in cardiomyocytes.RESULTS: AngⅡ can stimulate the CaN activity in cultured neonatal rat cardiomyocytes in a dose- and time-dependent manner. In cardiac myocytes incubated with 10, 100, 1000 nmol·L^-1 of AngⅡ for 12h, the CaN activities increased respectively by 13%,57%(P＜0.05) and 228%(P＜0.01) compared with that in non-stimulated cardiomyocytes. The CaN activities in AngⅡ-stimulated cardiomyocytes were significantly inhibited by losartan(50 μmol·L^-1), H₇(50 μmol·L^-1)and Fura-2/AM(4 μmol·L^-1),while no effect was observed with PD98059(50 μmol·L^-1).The [³H]-leucine incorporation in AngⅡ-stimulated cardiomyocytes increased by 46%(P＜0.01) compared with that in control group, which was dramatically inhibited by cyclosporin A(0.5~5μg/mL). CONCLUSIONS: Calcineurin, a Ca²⁺/calmodulin-dependent protein phosphatase, may play an important role in AngⅡ-induced cardiac myocyte hypertrophy. The activation of CaN may dependent on the sustained increases of [Ca²⁺]i and be regulated by some protein kinases (such as PKC,etc.).     

5个虹鳟（Oncorhynchus mykiss）群体的生化遗传分析

采用不连续聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳技术,测定和比较了道氏虹鳟、美国加州虹鳟、挪威虹鳟、丹麦虹鳟、芬兰虹鳟5个群体的15种同工酶约40个基因座位的遗传变异。结果表明,5个虹鳟群体的多态座位比例为43.24%~47.37%;种群平均预期杂合度为0.1917~0.2178,平均实际杂合度为0.2703~0.3291;Hardy-Weinberg 遗传偏离指数(d)为0.4100~0.5331,位点有效等位基因数(Ne)为1.4865~1.5385。χ2检验表明,5个虹鳟群体多态座位基因频率均符合Hardy-Weinberg平衡。与其它鱼类相比,5个虹鳟群体的遗传多样性均处于较高水平,表明本研究的5个虹鳟群体种质资源状况尚好。聚类分析表明,挪威虹鳟、丹麦虹鳟、美国加州虹鳟、道氏虹鳟为同一聚类支,芬兰虹鳟为另一聚类支。本研究对5个群体虹鳟养殖品种的同工酶分析,为其种质资源保护和开发以及遗传育种等方面提供了基础性资料。 关键词：虹鳟;群体;同工酶;遗传结构;遗传变异     

AFLP技术在水生动物遗传学研究中的应用

AFLP(Amp lifed Fragm ent Length P loymorphsim)技术是由荷兰Keygene公司科学家Zabeau和Vos发展起来的一种检测DNA多态性的一种方法[1],1993年获欧洲专利局专利,该方法是继RFLP(Restriction Fragm ent Length P loymor-phsim),SSR(S imp le Sequence Repeat)和RAPD(RandomAmp lified P loymorphsim DNA)之后发展最快的DNA指纹技术,是DNA指纹技术的重大突破,也是目前国际上最新最适用的DNA指纹技术。AFLP结合了RFLP和RAPD的特点,它兼有RFLP技术的可靠性和PCR技术的高效性,且具有快速、灵敏、稳定、所需DNA量少…     

水牛MFSD2A基因多态性及其与产奶性状的关联分析

【目的】研究水牛主要促进因子超家族成员2a(major facilitator superfamily domain containing 2a, MFSD2A)基因多态性,并筛选与水牛产奶性状相关联的SNP。【方法】采集383头健康水牛血液DNA,利用PCR扩增和Sequenom MassARRAY飞行时间质谱技术对SNP位点进行筛选及基因型检测,并进行遗传多样性、连锁不平衡(LD)和单倍型分析,以及对不同基因型和单倍型与水牛产奶性状进行关联分析。【结果】在水牛MFSD2A基因中检出7个SNPs位点,多态信息含量(PIC)均在0.25～0.40之间,属于中度多态,除g.8290 T>C位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);关联分析结果表明,这7个SNPs位点与305 d产奶量均显著关联(P<0.05),且突变杂合子基因型的305 d产奶量是3种基因型中最低的,g.568 C>G和g.701 A>G位点与乳脂率显著关联(P<0.05),乳脂率从大到小依次为突变纯合子>野生纯合子>突变杂合子,g.568...     

3种蚜虫对多异瓢虫生长发育和繁殖的影响

在25±1℃的条件下研究了3种蚜虫对多异瓢虫生长发育及繁殖的影响。结果表明,以不同蚜虫为食料时,多异瓢虫各虫态发育历期、存活率、世代历期、成虫寿命、成虫体重及生殖率等均存在显著差异(p<0.05);当以麦长管蚜饲喂时,多异瓢虫的世代历期、成虫寿命、产卵天数、成虫体重、单雌产卵量及内禀增长率分别为:22.7d、38.6d、16.2d、6.2mg、149.7粒及0.0725;当以桃粉蚜饲喂时,多异瓢虫的世代历期、成虫寿命、产卵天数、成虫体重、单雌产卵量及内禀增长率分别为:24.6d、31.5d、20.1d、6.0mg、100.5粒及0.0441;而当以棉蚜饲喂时,多异瓢虫的世代历期、成虫寿命、产卵天数、成虫体重、单雌产卵量及内禀增长率分别为:28.6d、25.5d、6.2d、4.2mg、45.3粒及0.0408;多异瓢虫的存活曲线均为I型。麦长管蚜对其适合性最高,其次为桃粉蚜,最次为棉蚜。     

基于机器学习的排涝闸站雨后水位预测

【目的】精准预测排涝闸站雨后水位。【方法】在分析为期1a的田间实测水位数据的基础上,收集了四湖流域2个典型闸站（习家口站、田关站）为期10 a(2010—2020年)的历史水情资料,利用2种机器学习算法（支持向量机回归算法、回归树算法）对排涝闸站的雨后水位进行预测分析。【结果】支持向量机回归算法和回归树算法均较好地预测了习家口站和田关站的雨后最高闸上水位,R2基本大于0.80;2种机器学习算法在习家口站的表现均优于田关站,核函数的选取对支持向量机回归算法的预测结果有一定影响,线性核函数表现较为稳定。回归树算法的效果略优于支持向量机回归算法。【结论】基于闸上水位、降水量、降水时间、泵站排水流量预测雨后最高闸上水位是可行的。不同闸站应分开进行训练,并寻找最优的机器学习算法,未来有必要结合降水预报数据实现农田涝灾情况的实时预报。