促卵泡生成素受体基因的SNP对牛双胎性状的标记研究

以秦川牛和荷斯坦奶牛的双胎母牛和单胎母牛为实验材料，以牛的FSHR基因的第10个外显子作为标记牛双胎性状的候选基因，用SNP法进行了多态检测。结果发现，在秦川牛的双胎母牛中突变率为60％（6／10），而在单胎母牛中突变率为20％（2／10）；在荷斯坦奶牛中，双胎母牛突变率为31.25％（5／16），单胎母牛突变率为6.67％（1／15）；由此可见双胎牛和单胎牛二者之间FSHR基因的第10个外显子的突变率差异明显。这表明选择FSHR基因的10个外显子有可能作为双胎性状的候选基因。经序列分析发现在FSHR基因的第1506个碱基发生了突变（T→C），但氨基酸没有发生变化。     

表型同型交配群体的Shannon信息熵和互信息

应用信息论方法研究了在表型同型交配下一对等位基因群体的基因型信息熵和互信息。在表型同型交配下,从随机交配下的平衡状态开始,群体的基因型信息熵逐代减少,但这种减少的趋势越来越慢,最终趋向于零。随着基因型信息熵的减少,群体的遗传多样性程度也越来越小。在表型同型交配下,群体的配子间互信息逐代增加,但这种减少的趋势越来越慢,最终趋向于零。配子间互信息的增加说明,配子间的信息交流程度逐代增加,两性配子间的信息关联程度越来越密切,而这用表型信息关联系数反映会更好。最后应用Matlab软件进行了数学模拟,直观验证了所得的结论。     

黄土沟坡刺槐林地土壤水分垂直变化的数学模型

2004,2005年4-10月,在位于黄土高原半湿润水分生态区的陕西省长武县,采用中子仪对刺槐人工林土壤水分垂直变化进行监测,运用隔室模型和2004年的实测数据建立降水在土壤中的入渗平衡模型:WC=a(e-kh-1)+c(1-e-k1h)+f,其中a>0,c>0,f>0,k1>k>0,k1和k分别为土壤入渗水的吸附速率和衰减速度.k,k1在特定取值条件下,模型可表达黄土高原刺槐林下不同的土壤水分生态环境.采用2005年5月实测数据对模型的拟合验证结果表明:拟合优度R2符合统计学要求,能很好地反映刺槐人工林地土壤水分垂直变化特征.     

约束组合性状

在动植物的选择中,除了选择指数外,目前已经提出了组合性状的概念,刘来福(1979)提出了遗传方差最大主成分性状,刘垂玗(1982)提出了表型方差最大主成分性状,杨德和戴君惕提出了典范性状。在选择指数中,我们构造一个指数,而这里则把性状X=(x_1,x_2,…x_m)′线性组合成一个新的综合性状F=a_1x_1+a_2x_2+…+a_mx_m=a′X,并赋于它特有的功能,如遗传方差最大、表型方差最大或遗传进展(遗传力)最大等。这就使我们对于多个数量性状的研     

不同交配方式下遗传平衡的信息学分析

阐述了二倍体生物群体多基因座整体达到最大信息熵时的配子频率分布和基因型频率分布与Hardy-Weinberg平衡分布的一致性.从信息学角度证明了不论是否存在连锁,随机交配下多基因座的配子平衡分布与基因型平衡分布总一致.与随机交配下的Hardy-Weinberg平衡相比,如果从交配方式上对群体施以其他的外部强制,群体发展的结果是最终会达到一个不随时间变化的状态,这个状态不是平衡态而是非平衡定态,此时配子信息熵和基因型信息熵具有极小值,这种非平衡定态是一种远离无外部强制作用下Hardy-Weinberg平衡状态的状态,与群体遗传学传统观点有所不同.     

可加效应的多因素试验的数据分析

关于有交互作用的正交试验的直观分析方法,有的著作只论述二水平试验的分析方法,对于三水平或三水平以上的试验,他们认为交互作用分析较为复杂,不作直观分析,只作方差分析;有的中虽然作了直观分析,但用的方法却和二水平试验一样,直接使用了交互作用列上的几个极差。我们认为这种方法是不妥的。本文从计算各因素的主效应及它们之间的交互效应出发,讨论了多因素试验的直观分析方法和方差分析方法,并将此方法应用于正交试验的分析中去。     

约束选择的研究概况及约束选择指数

一、约束选择的研究概况在动植物育种中,经常会遇到多个性状的问题。对于多个性状的选择,基于经济的考虑,Hazel(1943)提出了综合选择指数法。由于多个性状间普遍存在的相关性,一个性状的改良会使其它性状发生程度不同、方向不同的改变。综合指数法只是把握了多个性状经济复合值的变化,而没有考虑到一些特殊性状的具体情况。例如(Foulley,1976:Anderson,1977),用综合选择指数法选择青年公牛时,若考虑初生重和断奶     

长白猪胴体品质选择的研究

选取长白后备猪１０９头，肥育猪６４头为试材。测试结果表明，体尺性状与胴体性状存在极显著相关。在制定的三个选择指数中，利用典范相关分析和作者提出的决定系数遗传力提供的信息所构造的选择指数最适合。     

相对Shannon信息量与基因变异的测量

在ｓｈａｎｎｏｎ信息量的基础上,建立了相对纯合度信息量ＳＪ＇（Ａ＾２）、相对杂合度信息量ＳＨ＇（Ａ＾２）和相对信息量Ｓ＇（Ａ＾２）的概念,并赋予它们以遗传学意义。与纯合度Ｊ和杂合度Ｈ进行了理论比较,结果表明,二者在数量规律性上有很好的一致性,而各相对信息量有更好的性质。１－ＳＨ＇主要反映基因的确定度,ＳＨ＇（Ａ＾２）主要反映基因的变异度;Ｓ＇（Ａ＾２）与Ｋ无关,它能反映群体的遗传变异程度,亦能比较     

猪肉嫩度相关QTL整合定位与基因关联分析研究

为了优化猪肉嫩度相关数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),为基因的精细定位和克隆奠定基础。通过Meta分析,利用数学模型整合猪肉嫩度相关QTL,分析已知候选基因与“真实”QTL的关联性。收集猪肉嫩度相关QTL,将其逐一映射到美国肉畜研究中心(USDA-MARC 2.0)公布的猪遗传连锁图谱,构建整合图谱。进行Meta分析,得到精确性更高的“真实”QTL,并将已知候选基因映射到整合图谱,比较候选基因与各“真实”QTL的关联性。研究表明：99个猪肉嫩度相关QTL映射到参考图谱,构建成新的整合图谱。通过Meta分析,定位了16个“真实”QTL,图距2.42~25.18 cM,比较原始QTL缩短29.21%~93.18%。值得一提的是MQTL1和MQTL2,图距仅为2.42 cM和3.22 cM,且分别由9个和20个原始QTL聚合而成,有较高的研究价值。将FABP3、MYPN和ANK1基因映射到整合图谱,分别定位在MQTL5、MQTL12和MQTL16区间内,距离中心位置5.70 cM、3.67 cM和2.49 cM,可将这些区间作为关键区域,开展基因精细定位和挖掘工作。