柑橘大实蝇低覆盖度基因组及其分析

为探究柑橘大实蝇Bactrocera minax的全基因组信息,以海关口岸截获的柑橘大实蝇样本为材料,提取DNA后构建350 bp短片段文库,采用Illumina二代测序平台开展全基因组测序,进行基因组组装、完整性评估和注释分析。结果表明,柑橘大实蝇的基因组大小为368.14 Mb,重复序列占比为16.27%,杂合率为0.79%,属于中等杂合度基因组。基因组组装得到43 124条contigs,contig N50长度为94 994 bp。BUSCO评估显示,组装的基因组可完整覆盖98.80%昆虫保守的单拷贝直系同源基因,表明该组装的完整性很高,可以满足后续分析。通过EVM注释流程整合了从头预测、同源预测和基于转录组预测等不同方法的注释结果,共预测到35 655个蛋白编码基因,其中24 343个基因有功能注释。     

不同采收成熟度对南平上部烟叶产质量的影响

对上部叶采收成熟度把握不准，会导致上部4～6片烟叶一次性采收技术推广效果不理想，为此，我们研究云烟87上部4～6片烟叶的适宜采收成熟度，确定最有利于可用性提升的采收成熟度，为南平优质烤烟生产提供技术支撑。本文采用随机区组设计，设置3个处理，即T1处理，叶片8成黄采收；T2处理，叶片9成黄采收；T3处理，叶片全黄采收。各处理3次重复。结果表明，随着采收成熟度的提高，上部烟叶面积逐渐增大；上部烟叶9成黄采收烤后的外观质量和感官质量最好，还原糖含量较高，烟碱和钾含量适宜，协调性指标最高，产量低于8成黄采收处理，而其他经济性状指标均最高；T2处理的产值分别比T1和T3处理提高了9.50%和19.45%,提高了烟叶等级结构，提升了均价，综合经济性状好。总体而言，采收成熟度为9成黄的烟叶不仅烟碱含量适中，化学成分协调，外观质量和感官质量最高，且经济效益最好，最有利于高可用性提升的成熟度标准，建议在南平烟区采取上部烟叶9成黄时一次性采收。