基于全基因组信息的常山胡柚遗传鉴定

【目的】常山胡柚是我国一个优良地方柑橘资源,但对其遗传背景一直存在争议,有必要进一步探究常山胡柚的遗传背景。【方法】本研究基于全基因组重测序数据结果,并用分子标记进行验证,同时结合形态特征以及果实品质数据,将常山胡柚与相关柑橘资源进行系统比较。【结果】基因组重测序数据表明,常山胡柚中超过87.91%的遗传组分为柚橘杂合,柚纯合的遗传组分为9.77%,且全基因组序列与酸橙相似度较高,其中与江津酸橙序列相似度达88.34%,表明常山胡柚是一种酸橙。根据不同位点开发的4对InDel分子标记进行检测,也印证了常山胡柚与酸橙亲缘关系较近的结论。表型和品质数据表明,常山胡柚在叶片形态上与酸橙相近,且翼叶较小,果实形态类似酸橙,且单果质量、果皮厚度、种子质量、果皮质量等形态指标也与酸橙无显著性差异,而与橘、柚及葡萄柚存在显著差异。常山胡柚可滴定酸含量、固酸比等品质指标较酸橙明显优化。【结论】常山胡柚为酸橙遗传背景,是经长期栽培驯化后形成的一种果实品质改良的酸橙。