大花红景天谷胱甘肽 S-转移酶基因的分离与鉴定

以西藏大花红景天为试材,利用生物信息学和实时荧光定量PCR技术对谷胱甘肽S-转移酶(GST)基因家族中的11个成员进行分析,以期为红景天属GST家族基因的功能研究提供参考。结果表明:基于蛋白质序列比对可以将11个大花红景天RcGSTs基因分为6个亚组,分别为tau类(RcGSTU1、RcGSTU2、RcGSTU3);phi类(RcGSTF1、RcGSTF2、RcGSTF3、RcGSTF4);lambd类RcGSTL;微粒体类RcGSTM;theta类RcGST1;zeta类RcGSTZ。在线网站分析结果显示仅RcGSTM具有跨膜结构域,并定位于细胞膜,其它RcGSTs均无跨膜结构域并定位于细胞质。组织特异性与胁迫诱导表达模式结果表明,RcGSTs基因具有不同的组织表达特异性;低温胁迫下4个基因表达水平上调,7个基因下调;且脱落酸(ABA)可以诱导RcGSTs基因表达。     

西藏大花红景天EST-SSR开发及通用性分析

以西藏大花红景天为研究对象,用MISA软件筛选转录组测序获得的48790条unigene,开发EST-SSR(表达序列标签-微卫星序列)并对其通用性进行分析,以期为红景天属物种的遗传多样性研究和分子标记辅助育种奠定基础.结果表明,共检测出10761个SSR位点,分布于8973条unigene中,分布频率为22.06％,平均分布距离为4.725 kb.优势重复基序以单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸为主,其中单核苷酸重复单元以基序A/T为主,共7167个,二核苷酸重复单元以AG/CT为主,共1008个.随机合成280对引物,其中248对表现出有效扩增,54对具有多态性.此外,SSR引物在长鞭红景天、狭叶红景天、菊叶红景天、圣地红景天、柴胡红景天、高山红景天中具有较高的通用性,扩增效率分别为75.0％、73.75％、72.5％、62.5％、70.0％、72.5％.