刺芹侧耳交配型位点结构多态性分析

对刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)4个双核菌株的8个原生质体单核体进行基因组重测序和交配型位点的生物信息学分析,并对单核体之间的亲和性进行遗传分析.结果表明:8个单核体中含有3种A交配型位点和4种B交配型位点;其中3种A交配型位点都包含一对HD1 和HD2基因,以典型的'头对头'方式排列,HD基因两端有保...     

2021—2022年我国部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因变异分析

为深入了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行和遗传变异情况，2021—2022年，本课题组在我国13个省份约50个养殖场收集了117份临床疑似猪繁殖与呼吸综合征患猪样品，针对PRRSV的ORF5基因进行了遗传变异分析。通过实时荧光定量PCR鉴定PRRSV阳性样品和基因型，应用RT-PCR扩增PRRSV ORF5和ORF7基因，将阳性样本进行测序并开展系统发育学分群和GP5氨基酸突变分析。结果显示，共检出PRRSV-2阳性样品48份(总体阳性率约41%),经测序共获取38条ORF5序列和10条ORF7序列。所有ORF5序列间核苷酸相似性为77.1%～99.8%,ORF7序列间核苷酸相似性为83.3%～98.7%。系统发育学分群显示，谱系1占比60%(29/48,28株NADC30-like毒株，1株NADC34-like毒株),谱系3占比25%(12/48),谱系5.1占比5%(2/48),谱系8.7占比10%(5/48)。GP5氨基酸分析表明，信号肽(aa 1—26)、中...