中华猕猴桃蛋白磷酸酶PP2C75基因的生物信息学分析

蛋白磷酸酶PP2C是一类重要的信号分子,广泛参与ABA的信号转导途径,包括ABA调控对干旱等逆境胁迫的响应。为了探究PP2C基因在中华猕猴桃这类不耐旱型果树中的功能,本研究使用同源分析法对转录组中的中华猕猴桃蛋白磷酸酶PP2C75基因序列进行分析,利用网上在线分析工具分析其编码蛋白质的结构并预测其功能。研究结果表明,该核苷酸序列的开放阅读框为1 206 bp,编码401个氨基酸。其编码蛋白质属于亲水性蛋白,无信号肽,未形成跨膜结构域,具有一个完整且保守的PP2C催化结构域。通过三级结构建模和保守元件比较分析,发现PP2C75与其他响应干旱的PP2C基因有相同的保守元件,相似率达57%,与PP2C16的序列一致度最高,达48.66%。初步推测PP2C75参与ABA的信号转导途径且可能与猕猴桃的干旱胁迫相关。该研究结果可为后续的基因功能确证以及中华猕猴桃品种改良提供参考依据。     

甘蔗野生近缘种遗传多样性的ISSR分析

[目的]评价甘蔗野生种质资源的遗传多样性,为甘蔗抗逆定向遗传改良挖掘具有育种潜力的种质资源.[方法]对44份甘蔗野生近缘种材料按照割手密种内、斑茅种内以及种间3个层次运用ISSR进行遗传多样性分析.[结果]44个种间材料利用13条ISSR引物扩增,获得261条条带,其中259条为多态性条带、占比为99％;种间多态性依次...     

猕猴桃组织培养研究现状与展望

综述了猕猴桃组织培养中外植体、培养基、培养条件、炼苗和移栽等方面的研究现状,并提出猕猴桃组织培养的发展方向。     

AFLP技术的发展及其应用

扩增片段长度多态性（ＡＦＬＰ）被称为“下一代分子标记”,是检测ＤＮＡ多态性的一种新技术。该技术在农作物、蔬菜、林木、果树等植物的种质鉴定、遗传多样性分析、构建遗传图谱、基因定位和标记辅助育种等方面得到应用。     

云南高原湿地植物水葱的ITS序列分析

提取分布于云南高原湿地的水葱(Scirpus validus Vahl.)样品的DNA,采用ITS序列扩增通用引物,对其进行PCR扩增,并对PCR产物进行测序。从GenBank搜索并下载水葱属其他种类的ITS序列,并通过BioEdit、ClustalX 2.02和MEGA 4x1软件分析和构建系统发育树。分析结果揭示了水葱属14个种之间的亲缘关系,并确定了样品在种间的位置以及和其他种的亲缘关系。     

RFLP在植物遗传育种研究中的应用

RFLP作为一种主要的分子标记手段,在植物遗传育种研究中占有重要的地位.它较传统的形态学标记、细胞学标记和生化标记有明显的优点,现已广泛运用于遗传图谱构建、基因定位、数量性状位点(QTL)分析、外源染色体鉴定、遗传多态性分析、进化和分类研究、细胞质遗传研究等领域.     

抗蚜基因转化矮牵牛的初步研究

通过农杆菌介导途径,用叶盘转化法将抗蚜基因(雪花莲凝集素基因,GNA)转化到矮牵牛中,获得了具有抗蚜基因(GNA)的矮牵牛。     

基于ITS序列分析的部分榕属植物系统树构建

以榕属中黄金榕、橡皮树、小叶榕3个树种为研究对象,以其叶片为试材提取基因组DNA,进行ITS-PCR扩增。对扩增产物测序结果进行分析,在NCBI上选取同源率较高的27个树种的ITS序列与其进行同源比较,并建立系统树分析它们之间的亲缘进化关系。结果表明:30种榕属植物基于ITS序列分析与传统分类学略有差异,通过结合ITS鉴定与形态分类相结合可以为以后榕属的分类提供借鉴。     

竹子DNA提取方法改良及ITS-RFLP分析的初步研究

通过对传统方法的比较、改进,形成一种快速、简易的适用于竹子DNA提取的方法。另外,通过PCR扩增和7种限制性内切酶(AluⅠ、BbeⅠ、BbvⅠ、DpnⅠ、EagⅠ、hindⅢ和RsaⅠ)酶切,对云南世博园内的灰香竹、秀叶箭竹、云南箭竹和滑竹等4个竹种rDNA-ITS进行分析,发现竹子种间甚至是属间的rDNA-ITS序列的RFLP图谱差异很小,不适宜用来作竹子种属鉴定的标准。     

中华猕猴桃AcNOD基因的生物信息学分析

结瘤素(nodulin, NOD)是一类主要存在于根瘤细胞中并参与共生固氮作用的植物基因产物,在豆科植物的其他组织细胞中以及非豆科植物体内都有发现。为了探究NOD基因在中华猕猴桃这类非豆科植物中的作用和功能,本研究对其编码序列进行生物信息学分析。结果显示,该基因编码蛋白的分子式为C₄₃₂H₇₁₅N₁₃₁O₁₂₀S₃,含有94个氨基酸残基,等电点pI为10.68,属于疏水蛋白。带正电的残基(Arg+Lys) 11个,带负电的残基(Asp+Glu) 3个,不稳定系数为14.00,脂肪系数为107.23,总平均亲水性系数为0.395;AcNOD蛋白含有一个ENOD93保守结构域;二级结构显示该蛋白主要由59.57%的α-螺旋、17.02%的无规卷曲、15.96%的延伸链和7.45%的β-转角所组成;三级结构的预测结果显示该蛋白扭曲和折叠较多,亚细胞定位于内质网中,存在4个糖基化位点的12个磷酸化位点,不存在信号肽序列,有两个跨膜区域。进化树分析表明该蛋白与豆科植物结瘤素的同源性很高,...