Whole‐genome analysis identifying candidate genes of altitude adaptive ecological thresholds in yak populations

The domestic yak (Bos grunniens) is an iconic symbol of animal husbandry on the Qinghai–Tibet Plateau. Long‐term domestication and natural selection have led to a wide distribution of yak, forming many ecological populations to adapt to the local ecological environment. High altitude is closely related to oxygen density, and it is an important environmental ecological factor for biological survival and livestock production. The aim of the present study was to perform a preliminary analysis to identify the candidate genes of altitude distribution adapted ecological thresholds in yak using next‐generation sequence technology. A total of 15,762,829 SNPs were obtained from 29 yaks with high‐ and low‐altitude distribution by genome‐wide sequencing. According to the results of the selective sweep analysis with FST and ZHp, 21 candidate genes were identified. 14 genes (serine/threonine protein kinase TNNI3K, TEN1, DYM, ITPR1, ZC4H2, KNTC1, ADGRB3, CLYBL, TANGO6, ASCC3, KLHL3, PDE4D, DEPDC1B and AGBL4) were grouped into 32 Gene Ontology terms, and four genes (RPS6KA6, ITPR1, GNAO1 and PDE4D) annotated in 35 pathways, including seven environmental information processing and one environmental adaptation. Therefore, the novel candidate genes found in the current study do not only support new theories about high‐altitude adaptation, but also further explain the molecular mechanisms of altitude adaptation threshold in yaks.     

中国农业生态系统的合理发展

与自然生态系统不同,当今的农业生态经济系统是高度"人化"的系统。农业生态经济系统在人们的合理调控下,通过农业生态经济新秩序的建立,农村社会系统、农业经济系统和农业生态系统可以步入有序演化的轨道,实现可持续农业的发展目标。     

冬小麦品种数量性状的典型相关分析

对41份冬小麦品种产量构成因素、植株性状、穗部性状的典型相关分析表明：产量构成因素与穗部性状间、产量构成因素与植株性状间、穗部性状与植株性状间均呈显著相关,说明通过穗部性状、植株性状间接选择产量性状是可能的。     

利用MHC遗传标记对改则县本地牦牛与半野血牦牛群体遗传多样性评估

本研究利用MHC基因区域两个遗传标记（BF1和BM1258）对西藏阿里地区改则县的本地牦牛（GZD，16头）和半野血牦牛（GZY，18头）进行遗传多样性评估。研究结果显示：BF1位点的期望杂合度（HE=0.71996）和多态信息含量（PIC=0.66063）以及等位基因数（NA=11）都要高于BM1258位点（HE=0.56773、PIC=0.45553、NA=6），但BF1位点的观测杂合度（HO=0.30331）小于BM1258位点（HO=0.66471）。就群体而言，GZD的期望杂合度为0.6727±0.0934（HE±SD）、观测杂合度为0.5563±0.0892（HO±SD）以及PIC为0.58534，都高于GZY。GZD的近交系数（FIS=0.178）小于GZY（FIS=0.337）。通过两个微卫星位点基因型共构建了17种单倍型，GZD中含有12种单倍型，GZY中存在11 种单倍型。在单倍型水平上，GZD的期望杂合度（HE）为0.8759,观测杂合度为0.8000±0.1033，多态信息含量为0.8323，也略高于GZY相关参数两个群体之间的遗传分化指数在两个水平均显示为差异不显著（FST=-0.01370（位点水平），FST=-0.00300（单倍型水平）。总体而言，该两个牦牛群体的MHC免疫区域遗传多样性丰富暗示其抗病性和适应性遗传基础优秀，其次来那个群体遗传差异不明显，加之半野血牦牛种群近交系数偏高，故建议对该两个群体采取混群合并保种，提高种畜利用率，防止近交系数持续增高。     

放牧家畜采食量估测方法研究进展

放牧家畜采食量是评价草地生态系统转化效率和动物生产力的主要参数,受草地植被生长情况、环境条件、放牧方式、家畜生理特征及其瘤胃内环境等因素影响。放牧家畜采食量的准确测定一直以来都是食性研究的难点和热点问题,关系到动物营养状态的评估、补饲策略的制定以及食性理论的探索。传统采食量估测方法大多基于观察法或放牧前后牧草生物量差值法,这些方法对动物的干扰较小,但是受技术本身和适用范围的限制,如未能估测单个动物的采食量,很难适用于大范围的采食量估测。链烷烃技术和近红外技术的出现为准确测定采食量提供了前所未有的机遇,不仅能克服传统测定方法的缺点,还在准确率、适用范围（圈养动物和放牧动物）等方面优势较为明显,但由于粪便回收率和数据库完整性等因素的影响,目前应用于生物多样性较高草地的放牧动物采食量估测尚有难度。在简要总结不同方法的原理和影响因素基础上,综述了差值法、内标法、链烷烃法和近红外法在放牧家畜采食量测定方面取得的最新进展及存在的问题,并建议多种方法结合可以准确测定放牧家畜采食量,以期为制定合理的草地生态系统管理策略和实现草地可持续生态服务功能提供新思路和启发。     

延河流域主要水文要素时变过程分析

对延河流域降水、径流和泥沙等水文要素从20世纪中叶到21世纪初的年内分配及年际变化进行了时变过程分析。以探求区域植被重建对流域水文过程的影响情况。结果表明,三个水文基本要素都有不同程度的年内分布趋于均匀和年际变化趋缓的趋势。20世纪70-90年代比60年代流域平均面雨量分别减少了10.5%,11.7%和14.0%,年径流量分别减少了19.0%,12.9%和22.6%,年输沙量分别减少了21.1%,46.2%和41.7%。     

西藏绵羊溶血性曼氏杆菌分离鉴定及药敏特性研究

为探究西藏自治区山南市某地农户饲养的绵羊大批死亡的原因,采集病死羊心脏、脾脏、小肠、肺脏、气管等病料,进行细菌培养、分离鉴定、PCR检测、血清型鉴定、毒力基因检测及药敏特性分析。结果显示:从病死羊肺脏病料中分离出一株溶血性曼氏杆菌,血清型为2型;特异性PCR检测为阳性,证明分离菌株为溶血性曼氏杆菌;药敏试验结果显示,分离的溶血性曼氏杆菌对大多数临床常用抗生素敏感;主要毒力基因lktA检测为阳性。该研究首次从西藏绵羊分离出溶血性曼氏杆菌,并研究了其药敏特性,为该病的诊断与治疗提供了参考。     

帕里牦牛杂交后代不同部位牦牛肉营养成分测定分析

旨在研究3岁帕里牦牛杂交后代（帕里牦牛♂×林周牦牛♀）公牛不同部位（上脑、西冷和米龙）肉营养成分和西冷部位挥发性风味物质组成。根据食品国家安全标准测定方法及气相色谱-质谱联用系统测定不同部位肉氨基酸、脂肪、蛋白质、水分、脂肪酸含量和西冷部位挥发性风味物质相对含量。结果表明,林周本地公牦牛上脑部位苯丙氨酸、精氨酸和脯氨酸含量显著低于帕里牦牛杂交后代（P<0.05）。林周本地牦牛西冷部位脂肪含量显著高于帕里牦牛杂交后代（P<0.05）,而帕里牦牛杂交后代米龙部位脂肪含量有下降趋势（P<0.1）,水分含量有增加趋势（P<0.1）。林周本地牦牛米龙部位C16:0、C18:0、C18:1n9c、C16:1和C18:2n6c含量显著高于帕里牦牛杂交后代（P<0.05）。林周本地牦牛共检出6大类9种不同的化合物,包括醛类、醇类、酯类、酸类、酮类和芳香类。帕里牦牛杂交后代共检出4大类9种不同的化合物,包括醛类、醇类、酯类和酮类。综上,林周本地牦牛与帕里牦牛杂交后代上脑、西冷和米龙部位肉氨基酸、脂肪、脂肪酸和风味物质组成有较大差异,利用帕里牦牛杂交可能影响牛肉脂肪含量、脂肪酸组成及风味。