适合转录组测序的芒果不同组织RNA试剂盒提取方法研究

为了探寻能够满足芒果各组织转录组测序要求的高质量RNA提取方法,以‘桂热芒82号’的叶片、花和果实为材料,从RNA提取质量和产率、琼脂糖电泳和RT-PCR结果分析、RNA测序质量评价这3个方面,对常用的3种试剂盒的提取效果进行了实验研究和评价分析。结果表明:以来自于天根生化科技有限公司的DP 419试剂盒提取的芒果各组织的RNA质量均较好,提取的RNA产率远高于其余两种试剂盒的提取产率;除以美伯生物医药技术有限公司的RM 103试剂盒提取芒果各组织所得RNA,经琼脂糖电泳未见有5S条带出现外,以其余两种试剂盒提取的芒果各组织的RNA都存在28S、18S、5S条带且RT-PCR分析结果理想;对以3种试剂盒提取所得的RNA进行完全测序,结果表明,3种试剂盒提取的RNA完全测序都大于98.99%,能满足RNA-Seq分析的要求。文中综合上述评判因素分析认为,天根生化科技有限公司的DP 419试剂盒是适用于芒果叶片、花和果实RNA提取的最优试剂盒。     

Meta种群理论模型与应用研究进展

关于Meta种群的研究是当今国际生态学的重要热点,是保护生物学、理论生态学和数学生态学的一个主要研究前沿。面对全球生境破碎片段化、生物多样性丧失的危机,Meta种群理论为保护濒危物种、种群提供新依据,也为生境破坏对物种造成的伤害做出预测和度量。本文首先全面分析和总结了Meta种群的已有概念、理论和模型,其次对Meta种群的应用进行了概括,为开展相关研究提供参考。     

超临界CO2萃取热带睡莲鲜样两种产物形态的挥发性组分与抗氧化活性比较

以超临界CO2萃取热带睡莲鲜样所得的精油与水相为材料,采用气相色谱-质谱联用法分析两者的挥发性组分,采用四种体外抗氧化法测定和比较两者的抗氧化活性.结果表明,精油的挥发性组分种类要明显多余水相的,且精油中主要组分为萜烯类化合物,含量最高组分为6,9-十七碳二烯(含量为25.41％),水相中主要组分为芳香醇类化合物,含量...     

潮汐系统下不同盐度水体对红花玉蕊幼苗 生理特性的影响

[目的]分析潮汐系统下不同盐度水体胁迫对红花玉蕊幼苗生理特性的影响,为美化水岸环境及恢复红树林和湿地植被提供参考依据.[方法]模拟半日潮,每天在温室分别以不同盐度(5‰、10‰、15‰、20‰、25‰、30‰、35‰和40‰)水体对一年生红花玉蕊实生苗进行完全浸没胁迫处理12 h,以浸泡0盐度水体为对照(CK),处理后第3 d开始调查各处理幼苗的形态指标,处理后第7 d取样测定各处理的超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性、丙二醛(MDA)和脯氨酸(Pro)含量及叶绿素荧光参数(Fv/Fm),综合分析红花玉蕊的耐盐性.[结果]胁迫红花玉蕊幼苗的水体盐度超过20‰时,其叶片脱落率迅速增加.5‰盐度水体协迫处理红花玉蕊幼苗叶片的SOD活性显著低于CK(P<0.05,下同),随着水体盐度的升高,SOD活性总体上呈升高趋势,但均低于CK.当水体盐度高于15‰时,POD活性均显著高于CK,并在水体盐度30‰时达最高值.MDA含量随水体盐度升高呈先升后降的变化趋势,水体盐度为25‰时MDA含量最高,在40‰时最低,但与CK相比,各盐度水体协迫处理的MDA含量均无显著差异;Pro含量随水体盐度的升高而升高,但水体盐度为5‰时,Pro含量比CK稍微上升,说明红花玉蕊可能也适合在5‰水体盐度下生长.Fv/Fm随水体盐度的升高而降低,与Pro含量和叶片脱落率的变化趋势相反.[结论]红花玉蕊幼苗能适应5‰盐度水体淹浸12 h胁迫;在不同盐度水体胁迫下的叶片脱落率和Fv/Fm均可作为耐受水体盐度胁迫伤害程度的参考指标;POD活性和Pro含量可作为红花玉蕊幼苗耐受盐度胁迫响应的生理指标.     

曼陀罗及其变种对温度变化的适应性研究

为探究入侵杂草曼陀罗和紫花曼陀罗对温度变化的适应性,利用人工培养箱调控温度条件,研究曼陀罗(Datura stramonium)及其变种紫花曼陀罗(Datura stramonium var.tatual)在20、25、30和35℃环境下,两者叶片色素含量、茎中类黄酮和总酚含量及变化趋势差异,以及叶片解剖结构的差异.研究结果显示:同温度下曼陀罗栅栏组织厚度与海绵组织厚度之比小于紫花曼陀罗,上、下表皮气孔指数均明显低于紫花曼陀罗;紫花曼陀罗叶片叶绿素/类胡萝卜素值随温度变化呈先升后降趋势,曼陀罗叶片的叶绿素/类胡萝卜变化趋势无规律性;同温度下紫花曼陀罗的花青素苷、总酚、类黄酮含量显著高于曼陀罗.研究结果从植物形态结构和生理特征方面显示出,紫花曼陀罗对温度变化的适应能力高于曼陀罗.     

‘保罗兰’睡莲花粉离体萌发及花粉管生长的研究

【目的】研究不同培养基组分、不同培养时间对‘保罗兰’睡莲花粉萌发和花粉管生长的影响,为睡莲杂交育种提供科学的依据。【方法】采用花粉离体萌发法,用显微镜观察花粉离体萌发情况。【结果】20和40 mg/L的硼酸(H_3BO_3)处理均能促进花粉萌发,适宜浓度的蔗糖和低浓度的Ca~(2+)处理能显著提高花粉的萌发率;睡莲花粉在培养的4 h之内,花粉萌发率上升较快,4～6 h萌发率趋于稳定。花粉管生长在前2 h生长较快,2～6 h生长趋于稳定。【结论】10%蔗糖+20 mg/L或40 mg/L H_3BO_3+20 mg/L氯化钙(CaCl_2)是‘保罗兰’睡莲花粉最适萌发培养基组分,最佳镜检时间为4 h。     

杧果矮化基因GA2ox的克隆、亚细胞定位及表达分析

【目的】为研究杧果树体发育过程中GA合成调控以及GA信号转导的作用提供参考,并为矮生型杧果品种及矮化砧木的选育提供参考。【方法】以广西地方具有矮化特性杧果品种‘桂热杧82号’无病虫侵害的嫩叶为材料,对其GA2ox基因克隆,并进行亚细胞定位及表达分析。通过改良Trizol法提取叶片总RNA,利用简并引物克隆GA2ox基因片段,采用RACE法得到基因的全长cDNA序列,命名为MiGA2ox。通过生物信息学方法分析其结构特征,利用GFP进行亚细胞定位,采用实时荧光定量RT-PCR技术研究MiGA2ox基因在‘桂热杧82号’与乔化品种‘金煌杧’中的表达特性。【结果】MiGA2ox全长cDNA序列为2 051 bp,含有3′非翻译区约900 bp,5′非翻译区约400 bp。GA2ox序列均含有完整的开放阅读框,终止密码子为TGA,编码341个氨基酸,与橙子(XM_006467404.3)、柑橘(XM_006449629.2)、木薯(XM_021738345.1)、巴西橡胶树(XM_021820571.1)、陆地棉(XM_016896568.1)、中棉(XM_012597405.1)的一致性分别为79%、79%、78%、78%、76%、75%。MiGA2ox编码蛋白的相对分子质量为38 729.4 Da,等电点为6.56,为稳定蛋白,无信号肽,无明显疏水区,无跨膜结构域。根据共聚焦激光扫描显微镜观察结果可知,MiGA2ox编码蛋白定位于细胞核中。在随机选择2个时间节点,矮化品种‘桂热杧82号’MiGA2ox的表达量均高于乔化品种‘金煌杧’。【结论】‘桂热杧82号’MiGA2ox基因的表达与其矮化性状有关。     

中国莲PHT1家族成员的生物信息学分析

以植物PHT1家族蛋白为研究对象,基于中国莲(Nelumbo nucifera)全基因组数据库,利用生物信息学方法发掘中国莲可能存在的PHT1家族成员,并对中国莲PHT1家族成员进行序列比对、系统进化、保守序列、跨膜结构、二级结构和亚细胞定位等分析。结果表明,从中国莲全基因组数据库中筛选获得4个PHT1蛋白,分别命名为:Nn PHT1:1、NnPHT1:2、NnPHT1:3、NnPHT1:4。它们在植物PHT1家族中属于GroupⅠ,均含有保守序列:GGDYPLSATIxSE。该序列具有11~12个跨膜区域,且保守序列位于第4个跨膜区域内,均定位于细胞质膜,且在细胞内侧第6和第7个跨膜区域之间均含有一个较大的细胞胞质内环结构;磷酸化位点和糖基化位点的数量范围分别在33~50个和4~9个;二级结构中α-螺旋和无规卷曲结构的数量总和均高于70%。研究结果展示了中国莲的PHT1家族成员的序列基本信息和结构特点,为深入研究中国莲的该家族成员基因及其编码蛋白的结构功能提供理论依据。