肠炎沙门菌感染鸡lncRNA表达谱分析

研究旨在分析鸡感染肠炎沙门菌后长链非编码RNA(lncRNA)的表达谱,了解lncRNA在肠炎沙门菌感染过程中发挥的作用.通过提取脾脏组织总RNA进行高通量测序,利用生物信息学方法进行比较分析.根据差异显著的lncRNAs与mRNAs之间的位置关系预测lncRNAs顺式调控的邻近基因,并对邻近基因进行GO富集和KEGG...     

我国肉鸡养殖规模化发展现状调研分析

为摸清我国肉鸡养殖规模化发展现状,2013年6~8月,国家肉鸡产业技术体系在我国肉鸡养殖主要产区开展了大范围的调研活动,对我国肉鸡养殖规模的结构分布、经营模式等进行了详细调查与分析。结果显示,专业化的个体养殖和中等规模养殖是目前我国肉鸡养殖的主要生产形式,养殖规模越大,标准化、现代化的生产特征表现得越加明显。     

比较机器学习等算法对肉鸡产蛋性状育种值估计的准确性

我国白羽肉鸡育种中,通过遗传途径提高产蛋数和控制合适的蛋重是培育优良品系的一个重要方面。为探索适合我国白羽肉鸡育种中的基因组选择模型,本研究以2 474只白羽肉鸡品系的产蛋性状为研究对象,主要分析了机器学习算法KAML、BLUP(包括：PBLUP、GBLUP、SSGBLUP)和Bayes(包括：Bayes A、Bayes B和Bayes Cπ)方法对产蛋数和蛋重性状的预测准确性,准确性以5倍交叉验证进行评估。利用系谱以及基因组信息估计了产蛋数和蛋重性状的遗传力和遗传相关。结果表明,产蛋数性状遗传力为0.061~0.16,属于低遗传力性状;蛋重遗传力为0.28~0.39,属于中等遗传力性状;产蛋数与蛋重是中等遗传负相关(-0.518~-0.184),不同阶段产蛋数之间是强的遗传正相关(0.736~0.998)。不同模型预测43周产蛋数和52周蛋重的育种值估计准确性结果表明,KAML方法对两者的预测准确性分别为0.115和0.266,与GBLUP方法(准确性分别为0.118和0.283)和SSGBLUP方法(准确性分别为0.136和0.259)的准确性差异显著,同时显著低于Bayes方法(准确性分别为0.230~0.239、0.336~0.340)的预测准确性, PBLUP方法预测准确性最低(准确性分别为0.095和0.246)。因此,在白羽肉鸡产蛋数和蛋重性状中应用Bayes方法将获得最高的育种值估计准确性。     

快速与慢速肉鸡脂肪生长与肌苷酸含量比较

本试验旨在相同条件下,比不同品种和性别肉鸡的脂肪生长量和肌苷酸含量及其相互关系。比较发现:(1)快速与慢速肉鸡的各项脂肪指标均无显著差异(p>0.05),但慢速鸡的肌肉脂肪、皮下脂肪和腹脂率分别比快速鸡高7%、13%和37%;(2)慢速肉鸡肌苷酸含量比快速高50%,且差异显著(p<0.05);(3)母鸡皮下脂肪(p<0.01)和腹脂率(p<0.05)显著高于公鸡,母鸡肌间和肌肉脂肪也分别高于公鸡6%和12%(p>0.05);(4)肌苷酸与腹脂率存在显著正相关(r=0.61,p<0.05)。     

基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因

旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡,测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值(H/L)、超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)等表型数据,采集脾脏组织进行转录组测序(RNA-Seq)。基于RNA-Seq数据,结合表型进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明,热应激组相比于对照组,北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因,其中169个上调表达,144个下调表达;广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因,其中152个上调表达,83个下调表达。利用WGCNA分析,在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块,在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因,发现两品种中均存在TRIM29基因,说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析,揭示了不同鸡种在热应...     

北京油鸡喙畸形性状候选基因GLA多态性的研究

本实验旨在研究α-半乳糖苷酶(GLA)基因的多态性及其与北京油鸡喙畸形性状之间的关系。用直接测序的方法检测GLA基因的单核苷酸多态性。结果表明:该基因启动子的-524、-389、-242、-212 bp处,内含子6的4 494、4 505、4 552、4 691 bp处以及外显子7的4 815 bp处共发现9个突变位点。卡方检验显示,所有位点均符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。群体遗传多态性结果显示,正常鸡所有位点为中度多态(0.25PIC0.5);喙畸形鸡中,C4494T、G4505A、C4691T 3个位点为低度多态(PIC0.25),其余位点为中度多态(0.25PIC0.5)。基因型差异比较发现,在外显子7的C4815T位点处,喙畸形鸡未发生突变,与正常鸡基因型差异显著(P0.05);在内含子6的A4552C位点处,正常鸡AA型频率较高,喙畸形鸡CC型频率较高,两者基因型差异极显著(P0.01),其余位点差异不显著(P0.05)。结果提示,GLA基因的多态性与喙畸形存在一定关联,C4815T和A4552C 2个位点的SNPs有望成为剔除喙畸形性状的潜在遗传标记。     

鸡喙组织主要化学成分分析

地方鸡生产中,存在不同程度的鸡喙畸形现象,其中有些品种(或品系)发生率可达3％.喙畸形发生后,将不同程度影响鸡的采食,导致生长缓慢,产蛋减少甚至绝产,严重者死亡. 鸡喙为采食器官,由上下颌构成其骨质部分,表面被覆角质层[1].胚胎时期鼻骨以前的骨骼分为三部分,依次为前颌骨、前鼻骨软骨、鼻甲骨[2],出壳后上颌骨愈合为一体[3-5],鸡喙顶壁为硬腭,顶壁中部有一裂隙,为鼻后孔,许多唾液腺开口于顶壁和底壁的黏膜上,上颚有大量感应磁场的乳头状突起[6,7].     

脂肪型脂肪酸结合蛋白基因多态性与鸡肉品质性状的关系研究

采用PCR-SSCP技术分析了A-FABP基因在北京油鸡、矮脚鸡、泰和乌骨鸡、崇仁麻鸡、鹿苑鸡、霞烟鸡等6个地方品种鸡和AA肉鸡中的多态性,发现的3个多态位点的基因型频率和等位基因频率在不同品种之间存在显著差异。测序分析表明：多态位点的产生分别是由碱基C→T、G→A以及C→T的变异引起的。在北京油鸡、矮脚鸡群体中对各多态位点不同基因型与体重、肌内脂肪、腹脂率等脂肪相关性状进行关联分析,结果显示不同基因型间在部分肉品质相关性状上差异显著。     

维生素E水平和免疫应激处理对蛋鸡生产性能的影响

试验旨在研究维生素E水平和免疫应激对蛋鸡生产性能的影响。采用3×3双因子设计,270只19周龄健康来航蛋鸡随机分为9组,每组5个重复,每重复6只鸡。其中,3个日粮VE水平分别为0、40和100IU/kg,3种免疫应激方式分别为不注射、肌注生理盐水和肌注减蛋综合症疫苗。结果表明:VE对免疫应激给鸡群生产性能带来的不良影响具有部分缓解作用,在免疫应激状态下,鸡群对于VE的营养需求量增加。