大型迪庆藏猪不同生长阶段肌内脂肪沉积差异表达基因及其调控通路分析

【目的】筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段肌内脂肪含量差异的关键基因并分析其调控途径。【方法】选择胎次相同、出生日期及体重相近的大型迪庆藏猪36头,随机分为3组,在相同条件下进行育肥试验,分别在体重达40、80及120 kg左右时屠宰,每组采集3头猪的背最长肌,采用RNA-Seq技术进行转录组测序,测序数据进行拼接、比对和注释,筛选与脂肪沉积相关的差异显著基因进行功能富集、STEM分析,构建基因互作网络,并进行实时荧光定量PCR验证。【结果】40 kg vs 80 kg、80 kg vs 120 kg与40 kg vs 120 kg阶段分别检测到730、981及735个基因差异显著表达;STEM分析共有4个差异显著模块,模块11、14的基因集先显著上调后轻微下调;模块9、10的基因集先显著上调后显著下调。差异基因互作网络显示,40 kg vs 80 kg阶段,EGR1、EGR2、PRKAG2、NOR-1和ATF3基因位于网络核心,EGR1和EGR2基因表达下调,PRKAG2、NOR-1和ATF3基因表达上调;80 kg vs 120 kg阶段,FOXO1、PDK4、PPARD、PPARGC-1、LIPE、ATF3和STAT1基因位于网络核心,FOXO1、PPARD、PPARGC-1基因表达下调,PPARG基因通过级联调控引起STAT1基因表达下调,LIPE和ATF3基因表达上调;40 kg vs 120 kg阶段,ATF3、NOR-1、EGR1、EGR2和STAT1基因位于网络核心,EGR1、EGR2和STAT1基因表达下调,ATF3和NOR-1基因表达上调。ATF3、FOXO1等10个基因的实时荧光定量PCR验证结果与转录组测序结果一致。【结论】EGR1、FOXO1等基因作为核心基因参与大型迪庆藏猪肌内脂肪调控,不同生长阶段参与调控的核心基因并不完全相同,结果可丰富中国地方猪肌内脂肪调控基础数据,为大型迪庆藏猪肌内脂肪含量的遗传改良提供参考。     

育肥方式对滇南小耳猪肌肉氨基酸的影响

目的 研究育肥方式对迪庆藏猪生长、胴体和肉质的影响,筛选理想的养殖方式。 方法 分养殖场标准化育肥和放养+补饲2种方式进行迪庆藏猪育肥试验,测定其生长、胴体、体组分、肉质和肌肉化学成分。 结果 与放养+补饲育肥组相比,迪庆藏猪养殖场标准化育肥组平均日增质量提高53.29% (P<0.01),胴体皮率和骨率分别降低38.76% (P<0.05)和32.85% (P<0.01),脂率提高26.61% (P<0.05),胃质量率、小肠长、小肠质量和大肠质量分别降低27.93%、15.41%、56.20%和34.86% (P<0.01),花油率和板油率分别提高147.94% (P<0.01)和46.59% (P<0.01);肉色评分降低18.59% (P<0.01),失水率降低18.40% (P<0.01),粗蛋白质含量提高10.45% (P<0.05),肌内脂肪含量降低46.96% (P<0.01),pH、大理石纹、熟肉率、水分、干物质和粗灰分含量差异不显著 (P>0.05)。 结论 迪庆藏猪场养可提高生长速度,降低胴体皮和骨比重,增加背脂和腹脂沉积,提高肌肉保水性能和粗蛋白质含量,提高产肉性能和肌肉品质。     

藏猪选育群屠宰性能和肉质测定分析

目的研究迪庆藏猪与野猪×迪庆藏猪(野藏杂交猪)生长、胴体及肉质性状的差异,为迪庆藏猪的开发利用提供依据。方法选择胎次相同、出生日期相近、体质量约20 kg的迪庆藏猪及野藏杂交猪各12头进行育肥试验,体质量约60 kg时屠宰,比较其生长、胴体、体组分及肌肉品质。结果野藏杂交猪平均日增质量[(316±39) g]显著高于迪庆藏猪[(273±43) g] (P<0.05);屠宰率[(71.93±4.86)%]、骨率[(9.44±0.94)%]和瘦肉率[(50.43±2.25)%]分别比迪庆藏猪高8.94% (P<0.05)、18.74% (P<0.01)和15.59% (P<0.05),肥肉率[(30.33±3.19)%]、花油率[(2.48±0.63)%]和板油率[(4.46±0.24%)]分别比迪庆藏猪低21.30%、52.31%和41.78% (P<0.01);肌肉水分含量[(73.99±2.79)%]极显著高于迪庆藏猪[(69.14±2.65)%] (P<0.01),干物质含量[(26.01±2.79)%]和粗蛋白含量[(21.35±2.38)%]极显著低于迪庆藏猪[(31.92±2.98)%和(24.89±2.14)%] (P<0.01);肉色评分(3.81±0.26)显著高于迪庆藏猪(3.46±0.32) (P<0.05),大理石纹评分(1.88±0.23)和熟肉率[(61.30±1.96)%]显著低于迪庆藏猪[3.42±0.49、(65.37±1.54)%] (P<0.01、P<0.05),其他肉质指标与迪庆藏猪差异不显著(P>0.05)。结论与野猪杂交可提高迪庆藏猪生长速度、胴体骨率和瘦肉率,降低胴体肥肉率、花油率和板油率,且产肉性能优于迪庆藏猪,但是肌肉水分含量升高,干物质含量和蛋白质含量降低,肌肉大理石纹降低,野藏杂交猪肌肉的营养价值及食用品质不如迪庆藏猪。     

迪庆藏猪与野藏杂交猪肌肉全谱游离氨基酸味道强度值比较

本研究旨在探明迪庆藏猪与野猪×迪庆藏猪（野藏杂交猪）肌肉全谱游离氨基酸（FAA）味道强度值（TAV）的差异。选择胎次相同、出生日期相近、体重20 kg左右的迪庆藏猪和野藏杂交猪各12头（公、母各半）,以迪庆藏猪为对照,采用相同饲粮在相同饲养条件下直线育肥,100 kg左右屠宰,采集背最长肌,沸水蒸30 min后,用高效液相色谱-四级杆离子阱串联质谱仪检测其全谱游离氨基酸,计算呈味氨基酸TAV并比较其差异。结果显示,与迪庆藏猪相比,野藏杂交猪肌肉游离氨基酸总鲜味TAV降低16.27%（P<0.05）,总甜味、酸味和苦味TAV分别降低3.50%、11.68%和1.50%,但差异均不显著（P>0.05）;野藏杂交猪肌肉谷氨酰胺（Gln）鲜味TAV、甜味TAV均降低22.89%（P<0.05）,缬氨酸（Val）甜味、苦味TAV均增加36.32%（P<0.05）;天冬氨酸（Asp）、甘氨酸（Gly）、谷氨酸（Glu）与组氨酸（His）等其他游离氨基酸的鲜味、甜味、酸味和苦味TAV与迪庆藏猪间均差异不显著（P>0.05）。以上结果表明,与野猪杂交会降低迪庆藏猪肌肉鲜味TAV,降低Gln的鲜味、甜味TAV,提高Val甜味、苦味TAV,该结果可为迪庆藏猪的开发利用提供依据。     

大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长差异基因及其调控通路分析

为筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长差异的关键基因并分析其调控途径,以40、80和120 kg的大型迪庆藏猪为对象,基于RNA-seq技术对背最长肌组织进行转录组测序,对获得的测序数据进行拼接、比对、注释和差异分析,筛选与肌肉生长相关的差异基因进行STEM趋势分析、功能分析并构建差异基因互作网络。结果表明:1)10~40 kg阶段与40~80 kg阶段、40~80 kg阶段与80~120 kg阶段比较共检测到730 个、981 个基因显著差异表达;2)差异表达基因STEM趋势分析显示,共有4 个差异显著模块,模块11和14的差异基因先上调表达后轻微下调;模块9和10的差异基因先上调后下调表达;3)差异基因互作网络显示,10~40 kg vs 40~80 kg,FOS基因位于调控网络核心,与EGRs、CCL2和NOR-1等基因有互作关系,NOR-1基因上调导致肌肉生长速度加快,FOS基因下调抑制肌源性分化,EGRs基因下调导致胶原纤维束减少,CCL2基因下调导致肌肉再生受损;40~80 kg vs 80~120 kg,FOXO1、PDK4和PPARD等基因位于网络中心,SFRPs基因上调阻止成肌细胞终末分化,FZD7基因下调减缓肌纤维肥大速度,FOXO1下调导致肌生长抑制素mRNA下降减缓肌肉萎缩进程,PPARD与FOXO1均降低PDK4含量从而使肌肉丙酮酸脱氢酶复合物活性增强,对碳水化合物氧化和葡萄糖摄取增加,肌纤维变粗,与大型迪庆藏猪40至80 kg生长速度显著快于10至40 kg阶段,而80 kg之后缓慢下降的规律吻合;4)挑选了12 个差异基因进行qPCR验证,EGR1、SFRP1和FOXO1等12 个基因定量验证结果与转录组测序结果一致。综上,本研究利用RNA-seq技术筛选出12 个影响大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长的差异基因,可为解析地方猪肌肉生长的遗传调控机制、应用分子标记辅助选择提高迪庆藏猪瘦肉产量提供参考。