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本研究旨在阐明猪SRPK1基因的分子特点和表达谱。以大白猪为研究对象,利用RT-PCR技术克隆SRPK1基因CDS区域,同时利用反向PCR(inverse PCR,I-PCR)技术得到猪部分SRPK1的5′UTR序列;利用生物信息学方法分析SRPK1基因核苷酸序列及编码蛋白序列的结构特点;利用荧光定量PCR(real-time PCR)检测SRPK1在1和30日龄大白猪及杜洛克的心脏、肌肉、脾脏、肝脏、肾脏、肺脏、胃、小肠、大肠、脑的表达情况;构建猪骨骼肌损伤模型,研究在骨骼肌发育过程中SRPK1基因的表达特性。结果,将克隆片段拼接得到长2499bp的大白猪SRPK1基因序列,包含了1968bp完整CDS区域,分析表明其编码含656个氨基酸的蛋白质;包括2个P_Kc结构域,猪SRPK1蛋白序列与人和黑猩猩的相似性较高。通过生物信息学方法预测所得5′UTR含有多个转录结合位点:HSF1、HSF2、Ik-1、IK-2、SRY、SP1MyoD、USF、E47、p300、CP2、RREB-1、E2F和AP-1。利用荧光定量PCR研究发现,表达结果显示猪该基因表达具有组织和种间特异性,主要都是在胃、大肠和小肠中表达。SR-PK1基因在整个损伤修复过程中的表达反复出现升高和降低。5′UTR处有多个和肌肉生长相关蛋白的转录结合位点,主要在消化系统组织表达,在骨骼肌修复中表达上调,推测其可能与骨骼肌细胞发育或其他肌肉生长相关因子的表达有关。 相似文献
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肝细胞核因子-4α(HNF-4α)是肝细胞核因子(hepatocyte nuclearfactor,HNF)家族成员之一,可在肝脏内高表达,该家族基因对肝细胞的分化调控起关键作用,同时参与肝脏糖、脂代谢相关基因特异性表达的调控。HNF-4α基因参与调节生命代谢活动的诸多方面并且对动物生长发育过程起着重要作用。本研究采用PCR-SSCP的方法分析HNF-4α基因单核苷酸多态性与生长性状的相关性。结果发现SH1多态位点的BB基因型对法系长白猪个体的出生体长的效应值最大。SH2多态位点的AB基因型对法系长白猪个体的初生重的效应值最大。同时,该位点与大民猪肌纤维组织学特性也存在显著相关。AB型个体的肌纤维直径和肌纤维横截面积显著低于AA和BB型 (P<0.05)。 相似文献
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母猪产仔性状是评价猪场效益的重要指标,也是猪育种工作的重点。谷胱甘肽硫转移酶mu亚基(Glutathione S-transferase Mu2,GSTM2)基因是与母猪生殖系统免疫和生长发育有关的基因。研究采用PCRSSCP的方法分析了GSTM2基因的单核苷酸多态性,并分析了每个多态位点对母猪繁殖性状的影响。结果表明... 相似文献
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猪SRPK1基因的电子克隆 总被引:1,自引:1,他引:0
用小鼠和人的SRPK1基因的编码区序列通过NCBI数据库进行比较和检索,得到一个高同源性的猪cDNA序列和4个猪SRPK1基因的ESTs。利用DNAMAN软件将以上片段进行拼接,得到了一条较长的拼接片段X-1。ORF finder和Blast 2 sequence程序分析。结果表明,X-1中包含一个完整的长为1 968 bp的编码区,编码656个氨基酸,且此编码区DNA序列与人的SRPK1基因有91.73%的一致性,氨基酸序列的一致性为92.93%。 相似文献
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猪LXRα基因多态性及其与生长性状的相关性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
肝X受体α(LXRα)是-类与脂类代谢有关的核受体,是重要的脂质传感器,LXRα基因参与调节生命代谢活动的诸多方面并且对动物生长发育过程起着重要作用.本研究采用PCR-SSCP的方法分析LXRα基因单核苷酸多态性与生长性状的相关性.结果发现TB3多态位点的BB基因型对法系长白猪个体的出生胸围的效应值最大.TB4多态位点... 相似文献
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