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为淘汰香炉山鸡群体中的白羽基因杂合子个体,建立白羽基因纯合群体,本研究自行设计多重PCR扩增引物,采用PCR扩增结合琼脂糖凝胶电泳技术对120只香炉山鸡的基因型进行鉴定。结果显示:香炉山鸡隐性白羽CC型为56个,占总群体46.67%;Cc型为4个,占3.33%;cc为60个,占50%。经Popgene2.1软件统计分析发现隐性白羽基因位点平均等位基因数为2,有效等位基因数为1.9978,Shannon指数为0.6926,多态信息含量为0.3747,属于中度多态,说明该群体还具有一定的选育空间。本研究为香炉山鸡提供一种分子标记辅助选育方法,为该品种进一步的保护、开发与利用提供技术支撑,为其他鸡群选育研究提供参考。 相似文献
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香炉山鸡线粒体DNA D-Loop区遗传多样性及系统进化研究 总被引:1,自引:0,他引:1
试验旨在研究香炉山鸡的遗传多样性与系统进化。利用PCR扩增结合双向测序的方法对121只香炉山鸡线粒体DNA D-Loop(mtDNA D-Loop)区全长序列进行分析,并对mtDNA D-Loop区全长序列组成、变异与母系起源进行探讨。结果发现,香炉山鸡mtDNA D-Loop区全长序列为1 231~1 233 bp,A、T、C、G碱基含量分别为26.62%、33.55%、26.49%、13.34%,表现出T碱基含量最高,G碱基含量最低,A+T含量明显高于G+C含量,说明此区可能具有一定的碱基嗜好性;121条全长序列经分析发现共存在11种单倍型,26个变异位点,其中单一多态信息位点2个,简约信息位点24个,另外存在4处碱基插入与2处碱基缺失。遗传多样性分析发现,单倍型多样度为0.814,核苷酸多样度为0.00447,平均核酸差异数为5.494,表明香炉山鸡遗传多样性比较丰富,保种效果较好,具有一定的选育空间。经Tajima Test检测发现,Tajima’s D值为0.39378,检验结果不显著(P0.10),符合中性突变。聚类分析结果显示,香炉山鸡与红色原鸡聚为一支,说明香炉山鸡起源于红色原鸡;在分支内部又有4个分支,说明香炉山鸡存在多个母系起源。研究结果可为香炉山鸡种质资源保护与开发利用提供一定的参考数据。 相似文献
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