福建省龙岩地区蜱携带的新型弹状病毒全基因序列分析及流行病学调查

采集寄生于野猪、牛体表的蜱988只,其中台湾革蜱59只、微小牛蜱12只、台湾血蜱103只、豪猪血蜱214只和微小扇头蜱600只。根据蜱种、宿主、采集地点选取388只代表性蜱进行宏转录组测序分析,获得一个弹状病毒新种的基因组信息,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)与cDNA末端快速扩增技术(RACE)获取了该病毒全基因组序列,命名为龙岩蜱病毒(Longyan tick virus, LYTV)。通过对该病毒的全基因组序列特征分析发现,LYTV具有典型的Ledantevirus病毒属病毒的基因组结构特征。同源性分析表明,LYTV与最近亲缘病毒的核苷酸序列同源性为47.1%～59.1%,RNA依赖性RNA聚合酶L的氨基酸序列同源性为47.0%～56.1%,核蛋白N的氨基酸序列同源性为39.0%～54.6%。通过系统进化分析发现,LYTV与Nkolbisson virus(NKOV)亲缘关系最近,并与A亚群中的Yongjia tick virus 2(YjTV-2)、NKOV、Nishimuro virus(NISV)、Barur virus(BARV)、Fukuoka virus(FU...     

蜱携带牛丙型肝炎病毒新亚型巢式PCR检测方法的建立

旨在提高新发现的牛丙型肝炎病毒毒株——广东湛江毒株(bovine hepacivirus-GDZJ,BovHepV-GDZJ)的检测及诊断能力,初步了解广东地区蜱携带BovHepV-GDZJ的情况,本研究结合宏转录组学、高通量测序及PCR技术,针对高通量测序结果中丰度高的基因区域,设计该病毒的巢式PCR特异性引物.通过...