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基于转录组学筛选miR-125b-2敲除小鼠睾丸发育相关基因及信号通路的研究 总被引:1,自引:1,他引:0
旨在研究miR-125b-2对动物精子发生和成熟的调节作用,挖掘与miR-125b-2有密切靶向关系的功能基因及信号通路。本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,构建了miR-125b-2基因敲除小鼠模型。将3只野生型(WT)小鼠和3只miR-125b-2敲除型(KO)小鼠睾丸的总RNA样分别制成样品池,采用Illumina HiSeq~(TM)4000平台进行转录组测序(RNA-seq),将组装得到的Unigene序列注释到Nr和KEGG数据库中注释,并进行睾丸差异表达基因(DEGs)聚类分析。结果显示,在WT和KO组睾丸组织中共筛选出324个DEGs,其中被GO注释的180个DEGs显著富集到80个包括精子染色质缩合在内的生物学过程,22个含有线粒体内膜预序列转位酶复合物在内的细胞组成以及41个包括核糖体结构组成在内的分子功能。同时KEGG分析显示,所有被注释的DEGs显著富集到74条信号通路,其中排前3位极显著的信号通路依次为:RNA转运、信使RNA监视通路和合硒化合物新陈代谢。综上表明,敲除miR-125b-2主要影响睾丸中与精子染色质结构和线粒体功能相关基因的表达,其中与精子发生相关的3个基因Papolb、Tssk1和Slc22a14表达均显著上调。结果为进一步研究miR-125b-2对精子生成的功能调节提供基础。 相似文献
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利用2001年1~12月TRMM月降水量产品与我国622个台站的降水观测结果,分析了这2种资料所描述的我国降水分布的异同。结果表明,TRMM和地面站点观测的我国降水的空间分布形式大致相同,均能反映出我国降水的空间分布特征和季节变化特征,但2种资料在降水极值和极值区域范围大小等细节上仍存在一定差异,因此在使用TRMM数据前应该对其进行适当订正。 相似文献
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